41 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_2103 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  100 
 
 
255 aa  505  9.999999999999999e-143  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  48.42 
 
 
173 aa  82  0.000000000000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  33.06 
 
 
221 aa  74.3  0.000000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  32.58 
 
 
235 aa  64.7  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  38.04 
 
 
147 aa  57.4  0.0000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  32.99 
 
 
138 aa  53.5  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  33.7 
 
 
146 aa  53.9  0.000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  32.46 
 
 
152 aa  53.1  0.000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  35.23 
 
 
147 aa  52.4  0.000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  35.56 
 
 
152 aa  52  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  28.06 
 
 
151 aa  51.2  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  30.09 
 
 
161 aa  50.4  0.00003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  30 
 
 
146 aa  48.9  0.00007  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  32.95 
 
 
144 aa  48.9  0.00009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  30.68 
 
 
168 aa  48.9  0.00009  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  32.38 
 
 
144 aa  48.1  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  33.72 
 
 
148 aa  48.5  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  33.72 
 
 
146 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  32.56 
 
 
144 aa  47.4  0.0002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  29.46 
 
 
151 aa  47.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  30.28 
 
 
173 aa  47.4  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  30 
 
 
141 aa  47.8  0.0002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  33.33 
 
 
144 aa  46.2  0.0005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  34.83 
 
 
146 aa  45.1  0.001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  28.71 
 
 
140 aa  45.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  29.66 
 
 
153 aa  45.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  27.27 
 
 
147 aa  44.3  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  31.4 
 
 
116 aa  44.3  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  30.56 
 
 
144 aa  44.3  0.002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  27.1 
 
 
149 aa  43.5  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  29.2 
 
 
150 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  32.56 
 
 
116 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  33.33 
 
 
146 aa  43.5  0.004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  36.59 
 
 
212 aa  43.1  0.004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  29.07 
 
 
119 aa  42.7  0.005  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  31.63 
 
 
179 aa  42.7  0.005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  37.8 
 
 
209 aa  42.4  0.006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  29.76 
 
 
97 aa  42.4  0.007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  32.18 
 
 
116 aa  42.4  0.007  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  29.36 
 
 
145 aa  42  0.008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  32.18 
 
 
116 aa  42.4  0.008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>