91 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene NATL1_06371 on replicon NC_008819
Organism: Prochlorococcus marinus str. NATL1A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  100 
 
 
116 aa  238  2.9999999999999997e-62  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  98.28 
 
 
116 aa  235  2e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  78.45 
 
 
128 aa  196  6e-50  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  76.72 
 
 
116 aa  193  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  77.59 
 
 
116 aa  191  4e-48  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  75.86 
 
 
116 aa  189  2e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  73.28 
 
 
116 aa  184  4e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  69.83 
 
 
119 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  70.69 
 
 
119 aa  180  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  69.83 
 
 
126 aa  180  5.0000000000000004e-45  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  61.4 
 
 
125 aa  149  2e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  55.46 
 
 
119 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  55.46 
 
 
119 aa  140  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  50.85 
 
 
127 aa  121  4e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  52.88 
 
 
139 aa  110  7.000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  44.17 
 
 
139 aa  102  2e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  48.42 
 
 
104 aa  97.8  4e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  42.86 
 
 
143 aa  91.7  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  40.16 
 
 
133 aa  84.3  5e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  35.65 
 
 
109 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  35.48 
 
 
179 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  38.24 
 
 
111 aa  58.9  0.00000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  35.48 
 
 
210 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  35.48 
 
 
224 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  35.37 
 
 
110 aa  57.4  0.00000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  38.1 
 
 
172 aa  55.1  0.0000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  35 
 
 
347 aa  54.7  0.0000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  34.88 
 
 
131 aa  54.3  0.0000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  31.43 
 
 
173 aa  53.9  0.0000006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  33.67 
 
 
140 aa  54.3  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  35.53 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  33.33 
 
 
151 aa  52.8  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  38.46 
 
 
138 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  31.31 
 
 
221 aa  51.2  0.000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  35.71 
 
 
807 aa  50.8  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  28.7 
 
 
147 aa  50.8  0.000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  34.44 
 
 
212 aa  50.8  0.000006  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  32.05 
 
 
150 aa  50.8  0.000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  33.06 
 
 
144 aa  50.8  0.000007  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  36.44 
 
 
152 aa  50.1  0.000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  30.19 
 
 
137 aa  49.7  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  34.04 
 
 
186 aa  48.9  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  33.33 
 
 
209 aa  49.3  0.00002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  30.61 
 
 
235 aa  49.3  0.00002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.92 
 
 
417 aa  48.1  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  30.69 
 
 
160 aa  48.5  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  32.46 
 
 
156 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  42.19 
 
 
112 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  26.88 
 
 
264 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  36 
 
 
336 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  30.4 
 
 
160 aa  48.1  0.00004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  29.6 
 
 
160 aa  47.8  0.00005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  33.96 
 
 
144 aa  47.8  0.00005  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  32.99 
 
 
292 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  39.06 
 
 
157 aa  46.6  0.0001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  34.41 
 
 
150 aa  46.6  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  39.74 
 
 
318 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  30.69 
 
 
119 aa  46.2  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  33.33 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  33.65 
 
 
153 aa  45.8  0.0002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  31.09 
 
 
114 aa  45.4  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  34.45 
 
 
152 aa  45.8  0.0002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  36.14 
 
 
147 aa  45.4  0.0003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  30.77 
 
 
205 aa  45.1  0.0004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  32.39 
 
 
97 aa  44.7  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  31.58 
 
 
156 aa  44.3  0.0005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  30.43 
 
 
160 aa  44.3  0.0005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  29.84 
 
 
150 aa  44.3  0.0005  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  29.06 
 
 
141 aa  43.9  0.0008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  29.37 
 
 
159 aa  43.5  0.0009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  36.11 
 
 
123 aa  43.5  0.0009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.38 
 
 
85 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  32.99 
 
 
136 aa  43.5  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  31.18 
 
 
358 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  32.61 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  28.33 
 
 
167 aa  43.1  0.001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  31.37 
 
 
146 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  32.18 
 
 
255 aa  42.4  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  29.17 
 
 
104 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  31.3 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  34.15 
 
 
112 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  32.52 
 
 
272 aa  41.6  0.004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  33.04 
 
 
164 aa  41.2  0.005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  29.52 
 
 
176 aa  41.2  0.005  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  31.4 
 
 
161 aa  40.8  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  28.75 
 
 
144 aa  40.8  0.006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  31.15 
 
 
158 aa  40.4  0.007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  34.21 
 
 
72 aa  40  0.009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  27.85 
 
 
146 aa  40.4  0.009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  27.85 
 
 
148 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3376  blue (type 1) copper domain protein  32.53 
 
 
186 aa  40  0.01  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176163  normal  0.399462 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>