73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mnod_7873 on replicon NC_011887
Organism: Methylobacterium nodulans ORS 2060



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 156 aa  323  7e-88  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  73.12 
 
 		 160 aa  242  9.999999999999999e-64  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  75.64 
 
 		 156 aa  239  9e-63  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  80.6 
 
 		 160 aa  231  4.0000000000000004e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  59.87 
 
 		 165 aa  195  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  60.58 
 
 		 161 aa  187  2.9999999999999997e-47  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  54.48 
 
 		 151 aa  159  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  55.56 
 
 		 153 aa  155  2e-37  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  45.51 
 
 		 159 aa  149  2e-35  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  47.92 
 
 		 159 aa  144  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  44.52 
 
 		 163 aa  141  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  45.83 
 
 		 159 aa  140  8e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  47.37 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  48.12 
 
 		 164 aa  138  3e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  50.79 
 
 		 168 aa  134  4e-31  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  45.22 
 
 		 170 aa  133  9.999999999999999e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  48.03 
 
 		 181 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  43.71 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  48.03 
 
 		 171 aa  128  3e-29  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  43.71 
 
 		 162 aa  128  3e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  45.38 
 
 		 159 aa  126  1.0000000000000001e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  45.52 
 
 		 272 aa  126  1.0000000000000001e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  43.95 
 
 		 171 aa  124  4.0000000000000003e-28  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  44.09 
 
 		 164 aa  122  2e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  40.13 
 
 		 166 aa  120  6e-27  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  41.83 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  37.58 
 
 		 158 aa  114  5e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  47.97 
 
 		 180 aa  114  6.9999999999999995e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  46.4 
 
 		 160 aa  113  8.999999999999998e-25  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  40.94 
 
 		 166 aa  113  8.999999999999998e-25  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  42.52 
 
 		 159 aa  112  2.0000000000000002e-24  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  40.94 
 
 		 163 aa  111  5e-24  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  38 
 
 		 160 aa  107  5e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  49.55 
 
 		 176 aa  107  7.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  39.33 
 
 		 160 aa  107  7.000000000000001e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  40.15 
 
 		 154 aa  105  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  36.31 
 
 		 164 aa  105  2e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  33.33 
 
 		 182 aa  100  6e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  34.13 
 
 		 205 aa  97.1  8e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  33.33 
 
 		 177 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  33.75 
 
 		 177 aa  90.9  6e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  32.76 
 
 		 177 aa  86.7  1e-16  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  36.67 
 
 		 169 aa  83.2  0.000000000000001  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  37.5 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  32.8 
 
 		 189 aa  82  0.000000000000003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  29.65 
 
 		 167 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  29.12 
 
 		 185 aa  78.2  0.00000000000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  34.15 
 
 		 188 aa  77.4  0.00000000000007  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  33.08 
 
 		 190 aa  75.5  0.0000000000003  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  28.57 
 
 		 175 aa  71.2  0.000000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  27.91 
 
 		 175 aa  70.1  0.00000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  27.27 
 
 		 175 aa  68.2  0.00000000005  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  27.21 
 
 		 167 aa  54.7  0.0000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  24.82 
 
 		 534 aa  53.5  0.000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  28.93 
 
 		 157 aa  52.4  0.000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  29.69 
 
 		 161 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  23.88 
 
 		 314 aa  52  0.000003  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  23.44 
 
 		 147 aa  47.4  0.00008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  27.73 
 
 		 140 aa  45.8  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  26.13 
 
 		 505 aa  45.4  0.0003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  27.78 
 
 		 153 aa  45.4  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  31.58 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  31.58 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  28.95 
 
 		 178 aa  43.9  0.0009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  27.19 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  28.44 
 
 		 287 aa  42.4  0.003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2204  copper-resistance protein, CopA family  28.47 
 
 		 579 aa  41.6  0.004  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  27.72 
 
 		 125 aa  41.2  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0503  multicopper oxidase, type 3  28.28 
 
 		 479 aa  41.2  0.006  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.16251 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1998  nitrite reductase (NO-forming)  43.75 
 
 		 451 aa  40.8  0.007  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1850  copper-resistance protein, CopA family  26.11 
 
 		 659 aa  40.4  0.009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0157941  hitchhiker  0.0000000000246272 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  26.67 
 
 		 119 aa  40.4  0.009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  28.32 
 
 		 128 aa  40.4  0.01  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>