61 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_2055 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  100 
 
 		 144 aa  289  9e-78  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  75 
 
 		 144 aa  220  4.9999999999999996e-57  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  51.75 
 
 		 150 aa  142  2e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1359  pseudoazurin  51.61 
 
 		 141 aa  139  9.999999999999999e-33  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_2983  pseudoazurin  55.83 
 
 		 143 aa  137  6e-32  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.100451  normal  0.215076 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  53.23 
 
 		 150 aa  133  9e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  47.89 
 
 		 151 aa  133  9e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  49.14 
 
 		 147 aa  130  3.9999999999999996e-30  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0182  pseudoazurin  48.87 
 
 		 151 aa  130  6.999999999999999e-30  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  46.28 
 
 		 147 aa  127  7.000000000000001e-29  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  51.06 
 
 		 146 aa  115  1.9999999999999998e-25  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  48.15 
 
 		 146 aa  113  8.999999999999998e-25  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  45.9 
 
 		 173 aa  112  1.0000000000000001e-24  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal  1 
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4110  pseudoazurin  44.88 
 
 		 187 aa  112  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  50.54 
 
 		 168 aa  111  3e-24  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  50.54 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2245  pseudoazurin  45.69 
 
 		 146 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  42.75 
 
 		 153 aa  109  1.0000000000000001e-23  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  41.67 
 
 		 149 aa  108  3e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  43.57 
 
 		 144 aa  108  3e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  43.44 
 
 		 152 aa  100  8e-21  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  47.17 
 
 		 147 aa  100  9e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0684  pseudoazurin  50.56 
 
 		 157 aa  99  2e-20  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.341951  normal  0.75215 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  42.62 
 
 		 152 aa  97.4  6e-20  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  47.47 
 
 		 146 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  39.04 
 
 		 144 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  46.46 
 
 		 148 aa  94.7  4e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2331  PpaZ, a novel pseudoazurin precursor (blue copper protein)  40.16 
 
 		 152 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1006  pseudoazurin  40.16 
 
 		 152 aa  90.5  6e-18  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.428743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1597  pseudoazurin  38.64 
 
 		 163 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.759237  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  36.76 
 
 		 161 aa  85.1  3e-16  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  39.42 
 
 		 145 aa  82  0.000000000000002  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  31.82 
 
 		 146 aa  62.4  0.000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  35.05 
 
 		 138 aa  59.3  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  38.18 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  38.18 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  33.33 
 
 		 116 aa  52.8  0.000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  31.62 
 
 		 119 aa  51.6  0.000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  31.78 
 
 		 173 aa  51.2  0.000005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  32.2 
 
 		 255 aa  50.4  0.000007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  33.06 
 
 		 127 aa  50.4  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  35.65 
 
 		 139 aa  50.4  0.000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  32.43 
 
 		 116 aa  49.7  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  32.43 
 
 		 116 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  28.57 
 
 		 125 aa  49.3  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  30.97 
 
 		 221 aa  49.3  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  32.43 
 
 		 128 aa  47.4  0.00008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  33.33 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  33.33 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  32.11 
 
 		 126 aa  46.6  0.0001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  32.95 
 
 		 347 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  33.03 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  31.53 
 
 		 116 aa  45.1  0.0003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  28.74 
 
 		 172 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  28.1 
 
 		 144 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  32.97 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  32.58 
 
 		 205 aa  42  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  31.63 
 
 		 210 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  25.26 
 
 		 140 aa  40.8  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  27.83 
 
 		 139 aa  40.4  0.008  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  30.34 
 
 		 160 aa  40.4  0.009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>