111 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4006 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 
140 aa  291  2e-78  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  45.26 
 
 
137 aa  119  1.9999999999999998e-26  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  46.32 
 
 
144 aa  109  1.0000000000000001e-23  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  42.02 
 
 
141 aa  92  3e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  44.44 
 
 
146 aa  87.4  6e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  43.3 
 
 
807 aa  86.3  1e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  45.28 
 
 
146 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  38.95 
 
 
127 aa  75.5  0.0000000000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  36.55 
 
 
138 aa  73.9  0.0000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  33.09 
 
 
125 aa  67.8  0.00000000005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  35.79 
 
 
104 aa  66.2  0.0000000001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  36.75 
 
 
235 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  34.75 
 
 
264 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 
173 aa  62.4  0.000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  35.05 
 
 
116 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  33.68 
 
 
147 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  34.69 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  34.69 
 
 
119 aa  59.7  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  31.16 
 
 
119 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 
109 aa  58.9  0.00000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  31.39 
 
 
126 aa  58.2  0.00000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  34.02 
 
 
116 aa  57.8  0.00000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  34.68 
 
 
110 aa  57.4  0.00000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  35.34 
 
 
128 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  33.04 
 
 
221 aa  57  0.00000009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  29.7 
 
 
97 aa  56.6  0.0000001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  31.39 
 
 
114 aa  56.6  0.0000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  34.65 
 
 
157 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  32.63 
 
 
119 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  31.36 
 
 
179 aa  56.2  0.0000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  32.65 
 
 
139 aa  56.2  0.0000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  31.96 
 
 
116 aa  55.1  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  27.54 
 
 
161 aa  55.1  0.0000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  32.99 
 
 
116 aa  54.3  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  33.67 
 
 
116 aa  54.3  0.0000006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  33.67 
 
 
116 aa  53.9  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  32.65 
 
 
623 aa  53.5  0.0000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  31.36 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  33.87 
 
 
545 aa  53.1  0.000001  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  27.82 
 
 
151 aa  52  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  34.04 
 
 
152 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
136 aa  52.4  0.000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  35.11 
 
 
152 aa  52  0.000003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  32.65 
 
 
152 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  31.31 
 
 
110 aa  50.8  0.000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  32.67 
 
 
186 aa  50.8  0.000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  33.67 
 
 
139 aa  50.4  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  27.27 
 
 
444 aa  49.7  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  34.69 
 
 
143 aa  49.7  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  26.56 
 
 
150 aa  48.9  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.07 
 
 
417 aa  48.9  0.00002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  32.63 
 
 
358 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  33.68 
 
 
146 aa  47.8  0.00004  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  33.68 
 
 
168 aa  48.1  0.00004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  29.47 
 
 
150 aa  48.1  0.00004  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  31.63 
 
 
239 aa  47.4  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  28.1 
 
 
114 aa  47.4  0.00007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  27.34 
 
 
109 aa  47.4  0.00007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  33 
 
 
205 aa  47  0.00008  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_2900  pseudoazurin  31.58 
 
 
146 aa  46.6  0.0001  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.497446  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  34.18 
 
 
287 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  29.29 
 
 
116 aa  47  0.0001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  32.99 
 
 
179 aa  46.6  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  33.68 
 
 
72 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  29.81 
 
 
85 aa  45.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  31.33 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  28.71 
 
 
255 aa  45.4  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  31.33 
 
 
112 aa  45.4  0.0003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  33.73 
 
 
112 aa  45.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0533  hypothetical protein  29.79 
 
 
185 aa  45.1  0.0003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.528363  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  31.25 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  29.7 
 
 
120 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  31.33 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  26.32 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  27.82 
 
 
110 aa  44.3  0.0005  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  24.79 
 
 
114 aa  44.7  0.0005  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  27.37 
 
 
147 aa  44.3  0.0005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  33.33 
 
 
149 aa  44.3  0.0005  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  28 
 
 
123 aa  44.3  0.0006  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  32.65 
 
 
315 aa  44.3  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  27.37 
 
 
144 aa  43.9  0.0006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  28.42 
 
 
147 aa  43.9  0.0008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  31.96 
 
 
318 aa  43.9  0.0008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  31.63 
 
 
113 aa  43.5  0.0008  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  30.61 
 
 
113 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  25.42 
 
 
97 aa  43.5  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  27.78 
 
 
336 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  25.78 
 
 
144 aa  43.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  26.42 
 
 
160 aa  43.1  0.001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  28.33 
 
 
158 aa  42.7  0.002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  31.11 
 
 
192 aa  42.4  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  27.07 
 
 
113 aa  42.4  0.002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  30.21 
 
 
119 aa  42.7  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  31.25 
 
 
210 aa  42.4  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  29.17 
 
 
112 aa  41.6  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  28.87 
 
 
192 aa  41.6  0.003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1921  blue (type1) copper domain-containing protein  27.13 
 
 
126 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  32.97 
 
 
539 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  29.09 
 
 
121 aa  41.6  0.004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  25.26 
 
 
144 aa  41.6  0.004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>