86 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rpic12D_5106 on replicon NC_012849
Organism: Ralstonia pickettii 12D



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 160 aa  332  1e-90  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  81.88 
 
 		 159 aa  272  1.0000000000000001e-72  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  52.47 
 
 		 158 aa  168  2e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  47.24 
 
 		 163 aa  145  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  50.38 
 
 		 166 aa  140  7e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  55.83 
 
 		 168 aa  140  7e-33  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  51.13 
 
 		 164 aa  140  7e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  53.33 
 
 		 171 aa  139  9.999999999999999e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  46.53 
 
 		 170 aa  137  6e-32  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  43.23 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  43.23 
 
 		 162 aa  136  1e-31  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  48.94 
 
 		 272 aa  135  2e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  42.42 
 
 		 171 aa  130  5e-30  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  45.45 
 
 		 166 aa  130  7.999999999999999e-30  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  48.23 
 
 		 163 aa  128  3e-29  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  46 
 
 		 160 aa  126  1.0000000000000001e-28  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  44.65 
 
 		 160 aa  125  2.0000000000000002e-28  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  41.72 
 
 		 164 aa  124  5e-28  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  43.37 
 
 		 166 aa  124  5e-28  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  52.07 
 
 		 159 aa  124  6e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  52.07 
 
 		 164 aa  123  9e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  48.76 
 
 		 181 aa  121  5e-27  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  40.88 
 
 		 160 aa  120  8e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  43.55 
 
 		 154 aa  119  1.9999999999999998e-26  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  46.4 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  39.51 
 
 		 165 aa  114  6e-25  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  46.4 
 
 		 156 aa  113  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  44.8 
 
 		 156 aa  110  6e-24  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  44.35 
 
 		 159 aa  110  6e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  36.13 
 
 		 161 aa  105  3e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  38.52 
 
 		 151 aa  105  3e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  39.1 
 
 		 180 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  42.74 
 
 		 159 aa  104  5e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  43.75 
 
 		 176 aa  104  6e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  40.65 
 
 		 153 aa  100  6e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  37.16 
 
 		 159 aa  100  9e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  35.85 
 
 		 159 aa  99.8  1e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  38.36 
 
 		 177 aa  97.1  9e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  38.36 
 
 		 177 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  33.69 
 
 		 182 aa  94.7  5e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  38.57 
 
 		 177 aa  94  8e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  32.28 
 
 		 205 aa  94  8e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  39.5 
 
 		 188 aa  93.6  9e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  36.71 
 
 		 167 aa  92.8  2e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  32.53 
 
 		 169 aa  92.8  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  34.06 
 
 		 190 aa  92.8  2e-18  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  37.82 
 
 		 188 aa  92.4  2e-18  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  34.27 
 
 		 175 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  34.87 
 
 		 175 aa  90.5  9e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  34.9 
 
 		 175 aa  89.4  2e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  38.35 
 
 		 189 aa  82.8  0.000000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  33.12 
 
 		 185 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  28.87 
 
 		 534 aa  60.1  0.00000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  28.33 
 
 		 153 aa  51.6  0.000004  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1802  blue (type1) copper domain-containing protein  24.7 
 
 		 179 aa  50.4  0.000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.495145 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  31.03 
 
 		 116 aa  50.4  0.000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2073  blue (type1) copper domain-containing protein  29.6 
 
 		 161 aa  50.1  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.256815  normal  0.746059 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  28.26 
 
 		 505 aa  49.7  0.00002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  29.57 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  30.7 
 
 		 125 aa  48.9  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  28.81 
 
 		 139 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  25.52 
 
 		 140 aa  47.8  0.00007  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  29.31 
 
 		 116 aa  47.4  0.00009  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  28.7 
 
 		 119 aa  45.8  0.0002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  30.43 
 
 		 116 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  27.59 
 
 		 116 aa  44.7  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  28.57 
 
 		 139 aa  44.3  0.0007  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  30.43 
 
 		 116 aa  43.9  0.0009  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2921  blue (type 1) copper domain protein  27.36 
 
 		 125 aa  43.1  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0439603  normal  0.638215 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  26.42 
 
 		 140 aa  43.1  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  27.59 
 
 		 116 aa  43.9  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  29.31 
 
 		 128 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  28.21 
 
 		 314 aa  43.5  0.001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1437  membrane-bound dehydrogenase domain protein  30.28 
 
 		 1171 aa  42.7  0.002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.223688  normal  0.0591317 
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  29.13 
 
 		 178 aa  42.7  0.002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  31.03 
 
 		 127 aa  42.7  0.002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  27.16 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3677  hypothetical protein  25.71 
 
 		 157 aa  43.1  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  25.44 
 
 		 241 aa  42  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  29.2 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  29.2 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1641  multicopper oxidase type 3  27.54 
 
 		 526 aa  42  0.004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.972736  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  28.19 
 
 		 315 aa  41.2  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0511  membrane-bound dehydrogenase domain protein  32.43 
 
 		 1265 aa  41.2  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1576  hypothetical protein  26.32 
 
 		 167 aa  41.2  0.006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0471287  hitchhiker  0.0000128418 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1209  blue (type 1) copper domain protein  29.25 
 
 		 147 aa  41.2  0.007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>