43 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_3202 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 
807 aa  1561    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  47.01 
 
 
137 aa  115  3e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  49.06 
 
 
141 aa  101  5e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  40.91 
 
 
144 aa  95.5  3e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  43.3 
 
 
140 aa  86.3  0.000000000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  40.57 
 
 
146 aa  85.1  0.000000000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  39.29 
 
 
146 aa  84.7  0.000000000000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  37.62 
 
 
179 aa  57  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  36.36 
 
 
116 aa  56.6  0.000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  36.27 
 
 
347 aa  56.2  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  36.36 
 
 
186 aa  55.8  0.000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  35.19 
 
 
138 aa  55.5  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  36.36 
 
 
116 aa  55.1  0.000005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  36.36 
 
 
116 aa  55.1  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  35.05 
 
 
212 aa  54.7  0.000008  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  42 
 
 
210 aa  54.3  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  34.34 
 
 
127 aa  53.9  0.00001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  41 
 
 
224 aa  53.9  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  35.35 
 
 
116 aa  53.9  0.00001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  32.32 
 
 
104 aa  53.5  0.00002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  32.67 
 
 
205 aa  53.5  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  34.34 
 
 
116 aa  53.1  0.00002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  34.31 
 
 
119 aa  53.1  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  39 
 
 
136 aa  52.8  0.00003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  34 
 
 
119 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  34 
 
 
119 aa  52.4  0.00003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  31.63 
 
 
160 aa  52.4  0.00004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  34.31 
 
 
126 aa  52  0.00004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  34.02 
 
 
209 aa  51.6  0.00005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  35.71 
 
 
116 aa  50.4  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  34.31 
 
 
128 aa  50.8  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  34.65 
 
 
221 aa  49.7  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  31.19 
 
 
545 aa  50.1  0.0002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  32.35 
 
 
119 aa  49.3  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  35.64 
 
 
139 aa  48.5  0.0005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  32.99 
 
 
157 aa  48.1  0.0006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  37.78 
 
 
172 aa  47.8  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  32.08 
 
 
173 aa  47.8  0.0009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  32.35 
 
 
235 aa  47.4  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  29.82 
 
 
133 aa  46.2  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  31 
 
 
125 aa  46.2  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  27.78 
 
 
231 aa  45.4  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  33.67 
 
 
110 aa  44.7  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>