47 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_1509 on replicon NC_013743
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 146 aa  303  4.0000000000000004e-82  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  69.86 
 
 		 146 aa  216  8.999999999999998e-56  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  49.32 
 
 		 144 aa  138  1.9999999999999998e-32  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  45.14 
 
 		 137 aa  129  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  46 
 
 		 141 aa  125  2.0000000000000002e-28  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  41.56 
 
 		 138 aa  92  3e-18  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  40.57 
 
 		 807 aa  85.1  3e-16  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  45.28 
 
 		 140 aa  84.3  5e-16  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  33.33 
 
 		 125 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  29.58 
 
 		 127 aa  53.5  0.0000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  36.28 
 
 		 347 aa  53.5  0.0000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  32.54 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  32.54 
 
 		 119 aa  52.4  0.000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  31.68 
 
 		 110 aa  51.6  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  29.05 
 
 		 160 aa  51.2  0.000005  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  30.93 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  27.59 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  33.33 
 
 		 186 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  30.3 
 
 		 545 aa  47  0.00008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  29.17 
 
 		 179 aa  46.2  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  27.68 
 
 		 218 aa  46.6  0.0001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  58.06 
 
 		 116 aa  46.6  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  58.06 
 
 		 116 aa  46.2  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  49.02 
 
 		 235 aa  45.8  0.0002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  58.33 
 
 		 221 aa  45.4  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  27.27 
 
 		 147 aa  43.9  0.0008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  58.06 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  28.46 
 
 		 264 aa  43.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  58.06 
 
 		 126 aa  43.1  0.001  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  39.58 
 
 		 239 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  32.35 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  30.14 
 
 		 161 aa  42.4  0.002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  31.37 
 
 		 116 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  53.12 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  58.06 
 
 		 119 aa  42.7  0.002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  47.5 
 
 		 179 aa  42.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  25.87 
 
 		 121 aa  42  0.003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  54.84 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  27.96 
 
 		 157 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  26.9 
 
 		 119 aa  40.8  0.006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  27 
 
 		 192 aa  40.8  0.006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  32 
 
 		 172 aa  40.8  0.006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  28.87 
 
 		 152 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  31 
 
 		 173 aa  40.8  0.007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  32.09 
 
 		 486 aa  40.8  0.007  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  23.29 
 
 		 111 aa  40.4  0.007  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  24.55 
 
 		 120 aa  40  0.01  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>