27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_0152 on replicon NC_011729
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  100 
 
 		 143 aa  293  5e-79  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  49.22 
 
 		 127 aa  132  9.999999999999999e-31  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  48.06 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  48.06 
 
 		 119 aa  129  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  45.74 
 
 		 125 aa  121  4e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  44.83 
 
 		 139 aa  112  1.0000000000000001e-24  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  45.13 
 
 		 139 aa  107  6e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  46.28 
 
 		 116 aa  100  6e-21  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  43.8 
 
 		 116 aa  98.6  3e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  42.15 
 
 		 116 aa  95.9  1e-19  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  42.4 
 
 		 116 aa  94.7  4e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  36.07 
 
 		 133 aa  94  6e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  43.09 
 
 		 128 aa  94  6e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  41.67 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  42.99 
 
 		 119 aa  92.8  2e-18  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  42.86 
 
 		 116 aa  92  2e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  42.86 
 
 		 116 aa  91.7  3e-18  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  37.29 
 
 		 119 aa  86.7  1e-16  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  37.61 
 
 		 104 aa  78.6  0.00000000000003  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  34.69 
 
 		 140 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  32.22 
 
 		 110 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  31.07 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  30.77 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  27.66 
 
 		 138 aa  42  0.003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  26.67 
 
 		 110 aa  40.8  0.007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  26.95 
 
 		 137 aa  40.8  0.007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  31.43 
 
 		 221 aa  40.4  0.009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>