106 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9303_18341 on replicon NC_008820
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9303



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  100 
 
 
119 aa  245  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  77.97 
 
 
119 aa  199  9e-51  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  76.47 
 
 
128 aa  196  1.0000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  74.58 
 
 
126 aa  194  4.0000000000000005e-49  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  73.91 
 
 
116 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  73.91 
 
 
116 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  74.78 
 
 
116 aa  187  5e-47  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  73.04 
 
 
116 aa  183  7e-46  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  69.83 
 
 
116 aa  182  1.0000000000000001e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  69.83 
 
 
116 aa  182  2.0000000000000003e-45  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  54.92 
 
 
125 aa  145  1.0000000000000001e-34  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  53.78 
 
 
119 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  53.78 
 
 
119 aa  143  8.000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  50 
 
 
127 aa  130  3.9999999999999996e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  51.4 
 
 
139 aa  112  1.0000000000000001e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  43.52 
 
 
139 aa  99.8  1e-20  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  48.94 
 
 
104 aa  97.4  5e-20  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  37.29 
 
 
143 aa  86.7  1e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  39.52 
 
 
133 aa  85.1  3e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  34.92 
 
 
151 aa  57  0.00000008  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
109 aa  57  0.00000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  39.02 
 
 
110 aa  57  0.00000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  32.63 
 
 
140 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  35.83 
 
 
150 aa  53.9  0.0000008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  30.11 
 
 
224 aa  52.8  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  30.11 
 
 
210 aa  52  0.000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  34.62 
 
 
150 aa  51.2  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  31.25 
 
 
179 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2686  pseudoazurin  35.54 
 
 
173 aa  50.8  0.000006  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0680681  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  30.49 
 
 
147 aa  50.4  0.000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  35 
 
 
144 aa  50.4  0.000008  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  34.26 
 
 
111 aa  50.1  0.00001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.85 
 
 
417 aa  50.1  0.00001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  30.48 
 
 
137 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  39.06 
 
 
157 aa  50.1  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  30.11 
 
 
173 aa  49.3  0.00002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  32.47 
 
 
545 aa  49.3  0.00002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  35.56 
 
 
347 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  32.35 
 
 
807 aa  49.3  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  32.77 
 
 
171 aa  48.5  0.00003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  34.57 
 
 
147 aa  48.5  0.00003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  41.03 
 
 
318 aa  48.5  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  33.33 
 
 
153 aa  48.1  0.00004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  31.65 
 
 
144 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  32.61 
 
 
186 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  36.47 
 
 
172 aa  48.1  0.00004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  34.67 
 
 
116 aa  47.8  0.00006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  29.49 
 
 
264 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  31.91 
 
 
144 aa  47.4  0.00008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  31.4 
 
 
170 aa  47  0.00009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  29.75 
 
 
160 aa  47  0.00009  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  35 
 
 
150 aa  47  0.00009  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  33.61 
 
 
272 aa  46.6  0.0001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 
97 aa  46.6  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  30.58 
 
 
160 aa  47  0.0001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.38 
 
 
85 aa  45.8  0.0002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  31.67 
 
 
159 aa  45.8  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  31.58 
 
 
168 aa  45.8  0.0002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  32.22 
 
 
212 aa  46.2  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
336 aa  45.1  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  29.11 
 
 
148 aa  45.1  0.0003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  32.22 
 
 
209 aa  45.4  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  28.97 
 
 
152 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  29.17 
 
 
131 aa  44.7  0.0004  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  29.17 
 
 
156 aa  44.7  0.0004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  31.63 
 
 
144 aa  45.1  0.0004  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  31.71 
 
 
104 aa  44.7  0.0004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  29.11 
 
 
146 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  35.94 
 
 
112 aa  44.7  0.0004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  32.35 
 
 
138 aa  45.1  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  31.17 
 
 
109 aa  44.3  0.0005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  28.71 
 
 
235 aa  44.7  0.0005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  34.41 
 
 
358 aa  44.3  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  31.33 
 
 
123 aa  44.3  0.0005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3376  blue (type 1) copper domain protein  28.72 
 
 
186 aa  44.3  0.0005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176163  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  29.03 
 
 
292 aa  44.3  0.0006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  35 
 
 
161 aa  43.9  0.0007  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  30.34 
 
 
205 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  32.43 
 
 
164 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  31.07 
 
 
154 aa  43.5  0.001  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4222  pseudoazurin  32.94 
 
 
147 aa  43.1  0.001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  30.58 
 
 
153 aa  43.5  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  28.95 
 
 
145 aa  43.1  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  28.97 
 
 
152 aa  43.1  0.001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  31.17 
 
 
117 aa  43.1  0.001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  33.77 
 
 
179 aa  43.5  0.001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  34.62 
 
 
124 aa  43.5  0.001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  30.56 
 
 
141 aa  42.7  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  33.33 
 
 
136 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  26.26 
 
 
221 aa  42.4  0.002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  29.13 
 
 
160 aa  42.7  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  32.53 
 
 
112 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  30.49 
 
 
104 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1439  hypothetical protein  26.85 
 
 
103 aa  41.6  0.003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  32 
 
 
162 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6221  pseudoazurin  28.57 
 
 
149 aa  42  0.003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.517356  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  32 
 
 
162 aa  42  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  25.41 
 
 
151 aa  41.6  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  28.57 
 
 
114 aa  41.6  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  29.81 
 
 
159 aa  41.6  0.004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>