17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cwoe_3376 on replicon NC_013739
Organism: Conexibacter woesei DSM 14684



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013739  Cwoe_3376  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 
186 aa  364  1e-100  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.176163  normal  0.399462 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1897  blue (type 1) copper domain protein  34.72 
 
 
243 aa  74.7  0.0000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3041  blue (type 1) copper domain protein  44.21 
 
 
157 aa  64.3  0.000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.445011 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3846  blue (type 1) copper domain protein  35.9 
 
 
163 aa  58.9  0.00000004  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.884405  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  29.52 
 
 
287 aa  55.1  0.0000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  35.45 
 
 
139 aa  54.7  0.0000008  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1295  nitrite reductase (NO-forming)  28.57 
 
 
463 aa  52.4  0.000004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  32.46 
 
 
139 aa  50.8  0.00001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  29.59 
 
 
125 aa  46.2  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  31.97 
 
 
159 aa  45.4  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  32.71 
 
 
127 aa  44.7  0.0009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  28.72 
 
 
119 aa  44.3  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4905  blue (type1) copper domain-containing protein  32.09 
 
 
160 aa  42.4  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0465792  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  30.69 
 
 
116 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  29 
 
 
116 aa  42.4  0.004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  28.28 
 
 
119 aa  41.6  0.006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1089  hypothetical protein  41.18 
 
 
75 aa  41.6  0.007  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.778275  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>