65 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Avi_9849 on replicon NC_011986
Organism: Agrobacterium vitis S4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011986  Avi_9849  copper tolerance protein  100 
 
 		 159 aa  326  9e-89  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011986  Avi_9844  copper tolerance protein  93.08 
 
 		 159 aa  304  3e-82  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  83.02 
 
 		 159 aa  275  2e-73  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5863  blue (type 1) copper domain protein  75.54 
 
 		 159 aa  225  2e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2668  blue (type1) copper domain-containing protein  48.05 
 
 		 163 aa  152  2e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.975423  normal  0.234604 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  48.72 
 
 		 160 aa  148  3e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  51.85 
 
 		 156 aa  147  5e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  57.03 
 
 		 168 aa  145  2.0000000000000003e-34  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3995  blue (type1) copper domain-containing protein  47.24 
 
 		 180 aa  144  4.0000000000000006e-34  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.704782  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7873  blue (type 1) copper domain protein  47.92 
 
 		 156 aa  144  6e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  50 
 
 		 160 aa  141  3e-33  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3263  putative copper binding protein  48.82 
 
 		 176 aa  140  9e-33  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2721  blue (type1) copper domain-containing protein  47.14 
 
 		 166 aa  139  9.999999999999999e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0479159  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2197  blue (type 1) copper domain protein  45.71 
 
 		 164 aa  138  1.9999999999999998e-32  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4269  blue (type1) copper domain-containing protein  44.22 
 
 		 161 aa  137  4.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  0.25109 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3487  blue (type1) copper domain-containing protein  46.45 
 
 		 170 aa  135  2e-31  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  45.83 
 
 		 272 aa  134  5e-31  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1092  blue (type 1) copper domain protein  44.16 
 
 		 165 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_3425  putative copper tolerance protein  43.28 
 
 		 151 aa  128  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.792125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_3913  blue (type 1) copper domain protein  40.88 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.444429  normal  1 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4027  blue (type 1) copper domain protein  40.88 
 
 		 162 aa  128  4.0000000000000003e-29  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4551  blue (type1) copper domain-containing protein  48.8 
 
 		 171 aa  120  6e-27  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  37.65 
 
 		 158 aa  119  9.999999999999999e-27  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1267  blue (type1) copper domain-containing protein  42.86 
 
 		 171 aa  119  1.9999999999999998e-26  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00034808 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6520  putative copper tolerance protein (cupredoxin)  43.2 
 
 		 153 aa  117  6e-26  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.264526  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1207  blue (type 1) copper domain protein  40.79 
 
 		 160 aa  112  2.0000000000000002e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.0922177  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  41.33 
 
 		 164 aa  111  5e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2601  blue (type1) copper domain-containing protein  40.79 
 
 		 160 aa  110  6e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.377321  normal  0.709674 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2909  blue (type1) copper domain-containing protein  40.8 
 
 		 163 aa  110  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.272302  normal  0.0133564 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1635  oxidoreductase  42.15 
 
 		 181 aa  106  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.400621  normal  0.0387336 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1833  blue (type 1) copper domain protein  38.82 
 
 		 159 aa  107  1e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00584393 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0125  copper-binding protein  36.73 
 
 		 177 aa  102  2e-21  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0734  blue (type 1) copper domain protein  34.34 
 
 		 159 aa  101  3e-21  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.227893  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3980  blue (type 1) copper domain protein  43 
 
 		 166 aa  100  9e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  37.16 
 
 		 160 aa  100  9e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1667  blue (type1) copper domain-containing protein  37.27 
 
 		 164 aa  100  9e-21  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.393546 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2350  hypothetical protein  33.89 
 
 		 182 aa  95.5  3e-19  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4053  transposase Tn3 family protein  33.54 
 
 		 166 aa  95.5  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0575  blue (type1) copper domain-containing protein  31.93 
 
 		 154 aa  93.2  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0159129  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27840  hypothetical protein  30.77 
 
 		 205 aa  90.1  1e-17  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3854  uncharacterized copper-binding protein  31.58 
 
 		 177 aa  85.5  2e-16  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.874975 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2231  blue (type1) copper domain-containing protein  32.45 
 
 		 177 aa  84.3  6e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.503031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2232  hypothetical protein  28.95 
 
 		 185 aa  84  9e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.53865  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2159  plastocyanin/azurin family copper binding protein  31.35 
 
 		 175 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.0076427  normal  0.727347 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1676  blue (type1) copper domain-containing protein  29.94 
 
 		 167 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.549233  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3583  hypothetical protein  31.02 
 
 		 175 aa  79.7  0.00000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1700  blue (type1) copper domain-containing protein  31.49 
 
 		 175 aa  79  0.00000000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00435665 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0969  hypothetical protein  31.2 
 
 		 169 aa  77.8  0.00000000000006  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06367  hypothetical protein  32.52 
 
 		 188 aa  75.9  0.0000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001394  hypothetical protein  32.54 
 
 		 188 aa  75.5  0.0000000000003  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00000508588  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0713  hypothetical protein  32.54 
 
 		 190 aa  73.2  0.000000000001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0348  blue (type1) copper domain-containing protein  34.31 
 
 		 189 aa  66.2  0.0000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.471869 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2149  nitrite reductase, copper-containing  27.97 
 
 		 534 aa  57.4  0.00000008  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008537  Arth_4485  hypothetical protein  33.91 
 
 		 178 aa  50.1  0.00001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.475375  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1660  blue (type 1) copper domain protein  28.81 
 
 		 314 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2109  hypothetical protein  23.42 
 
 		 153 aa  48.1  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1833  blue (type 1) copper domain protein  38.89 
 
 		 241 aa  45.4  0.0003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.749286  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  25.6 
 
 		 153 aa  44.3  0.0007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  27.88 
 
 		 140 aa  42.7  0.002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2981  hypothetical protein  27.12 
 
 		 150 aa  43.1  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.227676  normal  0.693329 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2238  multicopper oxidase type 3  25.93 
 
 		 505 aa  41.6  0.004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.468125  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  29.81 
 
 		 119 aa  41.6  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0759  blue (type1) copper domain-containing protein  24.77 
 
 		 287 aa  41.2  0.005  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00521723  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3112  blue (type1) copper domain-containing protein  29.92 
 
 		 159 aa  40.8  0.008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2581  blue-copper-protein-like protein  25.2 
 
 		 147 aa  40.8  0.008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>