40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msed_1206 on replicon NC_009440
Organism: Metallosphaera sedula DSM 5348



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 545 aa  1075    Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0493  blue (type1) copper domain-containing protein  35.82 
 
 		 318 aa  114  4.0000000000000004e-24  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  37.5 
 
 		 318 aa  63.5  0.000000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  35.79 
 
 		 358 aa  59.3  0.0000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  31.86 
 
 		 336 aa  57.8  0.0000006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  30.56 
 
 		 179 aa  54.3  0.000006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  33.87 
 
 		 140 aa  53.5  0.000009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  32.63 
 
 		 239 aa  53.1  0.00001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  32.32 
 
 		 137 aa  52.8  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  30.28 
 
 		 287 aa  51.6  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  30.53 
 
 		 539 aa  51.2  0.00005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  29.29 
 
 		 131 aa  50.8  0.00007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  31.37 
 
 		 270 aa  50.4  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  36.63 
 
 		 127 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  32.35 
 
 		 141 aa  49.7  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  32.98 
 
 		 454 aa  49.7  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  31.19 
 
 		 807 aa  49.7  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 173 aa  49.7  0.0001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  35.56 
 
 		 280 aa  49.7  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  29 
 
 		 97 aa  49.3  0.0002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  32.47 
 
 		 119 aa  49.3  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  37.14 
 
 		 221 aa  49.3  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  31.37 
 
 		 144 aa  48.5  0.0003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  31.68 
 
 		 125 aa  48.5  0.0003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  31.58 
 
 		 152 aa  47.8  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  30.3 
 
 		 146 aa  47.4  0.0007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  29.93 
 
 		 138 aa  47.4  0.0008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  30.84 
 
 		 150 aa  46.2  0.002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  26.04 
 
 		 85 aa  45.4  0.003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  29.29 
 
 		 146 aa  45.1  0.003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  46.34 
 
 		 749 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  27.7 
 
 		 192 aa  45.1  0.004  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  26.52 
 
 		 235 aa  45.1  0.004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  24.63 
 
 		 109 aa  44.7  0.005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  34.65 
 
 		 152 aa  44.7  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  30.3 
 
 		 128 aa  44.3  0.005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  31.07 
 
 		 119 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  31.07 
 
 		 119 aa  43.9  0.007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  34.65 
 
 		 152 aa  43.9  0.008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  27.84 
 
 		 124 aa  43.5  0.009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>