14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_0493 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008541  Arth_0493  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 318 aa  665    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  33.93 
 
 		 545 aa  107  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  36.19 
 
 		 173 aa  50.1  0.00005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  34.26 
 
 		 112 aa  49.7  0.00007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  35.23 
 
 		 417 aa  49.3  0.00009  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  32.93 
 
 		 318 aa  48.9  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  30.69 
 
 		 119 aa  47.8  0.0002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  29.46 
 
 		 127 aa  46.2  0.0008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  26.88 
 
 		 347 aa  44.7  0.002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  30.34 
 
 		 315 aa  43.1  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  32.76 
 
 		 119 aa  43.1  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  28.8 
 
 		 125 aa  42.7  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  25.73 
 
 		 358 aa  42.4  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  36.05 
 
 		 444 aa  42.4  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>