59 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Htur_4301 on replicon NC_013744
Organism: Haloterrigena turkmenica DSM 5511



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 
235 aa  471  1e-132  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  48.21 
 
 
221 aa  195  4.0000000000000005e-49  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  48.62 
 
 
173 aa  99.8  3e-20  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  30.1 
 
 
255 aa  68.2  0.0000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  36.75 
 
 
140 aa  64.3  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  30.11 
 
 
137 aa  63.2  0.000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  29.51 
 
 
160 aa  62.8  0.000000004  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  31.16 
 
 
152 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  34.38 
 
 
152 aa  60.8  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  27.89 
 
 
179 aa  58.2  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  31.18 
 
 
144 aa  58.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  33.7 
 
 
146 aa  57  0.0000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  29.24 
 
 
347 aa  55.8  0.0000006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2576  halocyanin domain protein  27.64 
 
 
218 aa  54.3  0.000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  28.49 
 
 
138 aa  54.7  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  30.89 
 
 
224 aa  53.9  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  35.48 
 
 
210 aa  52.8  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  32.08 
 
 
145 aa  52  0.000008  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  25.47 
 
 
205 aa  50.4  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  33.33 
 
 
147 aa  51.2  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  27.97 
 
 
212 aa  50.1  0.00003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  32.58 
 
 
127 aa  49.7  0.00004  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  35.56 
 
 
186 aa  49.3  0.00006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  32.56 
 
 
125 aa  47.8  0.0001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  37.37 
 
 
141 aa  48.1  0.0001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  34.07 
 
 
110 aa  48.1  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  30.36 
 
 
147 aa  47.8  0.0001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  32.35 
 
 
807 aa  47.8  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1476  halocyanin domain protein  34.02 
 
 
231 aa  47.4  0.0002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  33.66 
 
 
126 aa  47.4  0.0002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  29.7 
 
 
116 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  32.97 
 
 
136 aa  47  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  26.63 
 
 
146 aa  46.6  0.0003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  31.76 
 
 
161 aa  46.6  0.0003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  29.7 
 
 
116 aa  47  0.0003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  35.29 
 
 
119 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  29.91 
 
 
148 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  35.29 
 
 
119 aa  46.2  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  29.91 
 
 
146 aa  46.2  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  34.69 
 
 
116 aa  45.8  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  34.69 
 
 
116 aa  45.4  0.0007  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  28.44 
 
 
151 aa  45.4  0.0007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  37.11 
 
 
623 aa  45.4  0.0007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  32.67 
 
 
119 aa  45.4  0.0008  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  28.71 
 
 
209 aa  44.7  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  33.67 
 
 
116 aa  45.1  0.001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  33.33 
 
 
144 aa  44.7  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  29 
 
 
104 aa  43.9  0.002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  26.52 
 
 
545 aa  44.3  0.002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  34.69 
 
 
128 aa  43.9  0.002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  30.97 
 
 
150 aa  43.5  0.003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  34.69 
 
 
116 aa  43.5  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  28.71 
 
 
119 aa  43.1  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  38.64 
 
 
146 aa  42.7  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008242  Meso_4276  pseudoazurin  27.03 
 
 
146 aa  42.4  0.006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  35.71 
 
 
172 aa  42  0.008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  30 
 
 
144 aa  42  0.008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  26.36 
 
 
153 aa  42  0.009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  28.43 
 
 
144 aa  41.6  0.01  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>