64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0815 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 
539 aa  1085    Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  51.85 
 
 
280 aa  103  1e-20  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  47.52 
 
 
318 aa  99  2e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  48.54 
 
 
239 aa  92.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  42.16 
 
 
315 aa  90.9  6e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  41.82 
 
 
623 aa  89.7  1e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  42.16 
 
 
152 aa  82.8  0.00000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  43.81 
 
 
358 aa  82.4  0.00000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  32.77 
 
 
287 aa  81.3  0.00000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  32.1 
 
 
444 aa  79.7  0.0000000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  41.24 
 
 
270 aa  79  0.0000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  42.59 
 
 
336 aa  74.7  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  38.64 
 
 
97 aa  74.3  0.000000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  41.57 
 
 
85 aa  73.6  0.000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  41.41 
 
 
454 aa  72.8  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  39.33 
 
 
109 aa  70.9  0.00000000006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  32 
 
 
114 aa  69.7  0.0000000001  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  39.77 
 
 
97 aa  69.3  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  37.35 
 
 
167 aa  68.6  0.0000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  38.2 
 
 
110 aa  68.2  0.0000000004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  36.27 
 
 
771 aa  65.5  0.000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  36.14 
 
 
174 aa  65.1  0.000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  34.83 
 
 
120 aa  63.5  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  35.96 
 
 
136 aa  63.2  0.00000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  40 
 
 
157 aa  61.6  0.00000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  30.16 
 
 
131 aa  61.6  0.00000003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0730  hypothetical protein  55.32 
 
 
432 aa  60.8  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  37.21 
 
 
112 aa  60.5  0.00000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  35.23 
 
 
179 aa  59.7  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  39.24 
 
 
72 aa  57  0.0000009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  39.24 
 
 
123 aa  57  0.0000009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  27.96 
 
 
113 aa  56.2  0.000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  32.38 
 
 
264 aa  55.5  0.000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
104 aa  54.7  0.000004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  28.07 
 
 
114 aa  54.3  0.000005  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  32.53 
 
 
192 aa  53.9  0.000008  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  33.71 
 
 
117 aa  51.6  0.00004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  32.47 
 
 
110 aa  51.6  0.00004  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  25.81 
 
 
112 aa  51.2  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  32.43 
 
 
104 aa  50.8  0.00005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  25.51 
 
 
112 aa  50.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  33.05 
 
 
301 aa  51.2  0.00005  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  25.81 
 
 
112 aa  51.2  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
112 aa  50.8  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  32.14 
 
 
119 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  30.68 
 
 
116 aa  50.8  0.00006  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  30.53 
 
 
545 aa  50.8  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  29.21 
 
 
114 aa  50.4  0.00008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  29.55 
 
 
123 aa  50.4  0.00008  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  26.88 
 
 
113 aa  50.4  0.00009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1142  blue (type1) copper domain-containing protein  32.67 
 
 
153 aa  49.3  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.036139 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  25.81 
 
 
113 aa  49.3  0.0002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1542  blue (type1) copper domain-containing protein  33 
 
 
154 aa  49.3  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  37.88 
 
 
456 aa  49.3  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  33.71 
 
 
149 aa  48.1  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  31.25 
 
 
156 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0533  hypothetical protein  38.89 
 
 
185 aa  46.6  0.001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.528363  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  35.96 
 
 
130 aa  45.4  0.002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3424  hypothetical protein  33.78 
 
 
113 aa  45.8  0.002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  26.44 
 
 
192 aa  46.2  0.002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6437  hypothetical protein  28.41 
 
 
107 aa  44.7  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  31.33 
 
 
124 aa  44.3  0.005  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  28.41 
 
 
105 aa  43.9  0.007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0004  hypothetical protein  22.46 
 
 
298 aa  43.9  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>