52 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hlac_0575 on replicon NC_012029
Organism: Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 141 aa  285  2e-76  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  56.74 
 
 		 137 aa  157  5e-38  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  49.29 
 
 		 144 aa  134  5e-31  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  47.33 
 
 		 146 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2424  blue (type 1) copper domain protein  47.33 
 
 		 146 aa  127  4.0000000000000003e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  49.06 
 
 		 807 aa  102  2e-21  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  40.58 
 
 		 140 aa  97.4  5e-20  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  38.96 
 
 		 138 aa  81.6  0.000000000000003  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  39.56 
 
 		 157 aa  54.3  0.0000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  38.78 
 
 		 358 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  31.2 
 
 		 127 aa  52  0.000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  37.27 
 
 		 347 aa  51.6  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  30.51 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  30.51 
 
 		 119 aa  50.8  0.000006  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  37.37 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  37.37 
 
 		 235 aa  49.7  0.00001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  34.48 
 
 		 97 aa  49.7  0.00001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  32.56 
 
 		 623 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  32.2 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  29.08 
 
 		 125 aa  48.9  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  30.67 
 
 		 126 aa  48.1  0.00003  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  32.35 
 
 		 545 aa  48.1  0.00004  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  30.71 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  32.23 
 
 		 131 aa  46.6  0.0001  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  30 
 
 		 116 aa  46.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  26.02 
 
 		 104 aa  45.4  0.0002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  32.26 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  29.29 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  38.37 
 
 		 239 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  31.48 
 
 		 116 aa  45.4  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  32.41 
 
 		 128 aa  44.7  0.0004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  29.41 
 
 		 119 aa  45.1  0.0004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  31.31 
 
 		 179 aa  44.7  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  34.65 
 
 		 221 aa  44.3  0.0006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  30 
 
 		 119 aa  44.3  0.0006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  30.61 
 
 		 85 aa  44.3  0.0006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  29.06 
 
 		 116 aa  43.9  0.0008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  36.36 
 
 		 136 aa  43.9  0.0009  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  33.67 
 
 		 160 aa  43.1  0.001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  29.06 
 
 		 116 aa  43.5  0.001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  31.68 
 
 		 173 aa  42.7  0.002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  31.63 
 
 		 264 aa  42.4  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  38.37 
 
 		 318 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  31 
 
 		 336 aa  42  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  35.71 
 
 		 136 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0533  hypothetical protein  30.77 
 
 		 185 aa  40.8  0.006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.528363  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  31.18 
 
 		 109 aa  40.8  0.006  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  31.4 
 
 		 539 aa  40.8  0.007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  30.95 
 
 		 167 aa  40.4  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  32.74 
 
 		 454 aa  40.4  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2103  hypothetical protein  30.1 
 
 		 255 aa  40  0.01  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  28.87 
 
 		 749 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>