131 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Tter_0247 on replicon NC_013525
Organism: Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 
157 aa  323  4.0000000000000003e-88  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  38.84 
 
 
264 aa  81.6  0.000000000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  44.09 
 
 
136 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  48.61 
 
 
112 aa  72.4  0.000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  48.53 
 
 
358 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  41.46 
 
 
114 aa  69.3  0.00000000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  40.59 
 
 
97 aa  68.2  0.00000000005  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  41.33 
 
 
110 aa  65.5  0.0000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  41.46 
 
 
109 aa  65.1  0.0000000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  33.33 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  33.33 
 
 
119 aa  64.7  0.0000000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  33.33 
 
 
119 aa  64.3  0.0000000006  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  41.03 
 
 
125 aa  63.2  0.000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.14 
 
 
85 aa  62.8  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  31.3 
 
 
301 aa  62.8  0.000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  33.72 
 
 
113 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  37.5 
 
 
179 aa  61.6  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  39.36 
 
 
140 aa  61.6  0.000000004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  32.23 
 
 
119 aa  61.6  0.000000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  40 
 
 
539 aa  61.6  0.000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
119 aa  60.5  0.000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  32.23 
 
 
126 aa  60.5  0.000000009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  34.04 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  36.7 
 
 
137 aa  60.1  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  34.04 
 
 
112 aa  60.1  0.00000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  35.11 
 
 
104 aa  59.7  0.00000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  38.24 
 
 
174 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6437  hypothetical protein  34.38 
 
 
107 aa  60.1  0.00000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  30.33 
 
 
127 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  38.14 
 
 
110 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  35.29 
 
 
123 aa  59.7  0.00000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  37.65 
 
 
117 aa  59.7  0.00000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  35.53 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  39.53 
 
 
119 aa  58.9  0.00000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  33.78 
 
 
116 aa  58.5  0.00000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  30.09 
 
 
116 aa  58.2  0.00000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  35.14 
 
 
807 aa  58.2  0.00000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  33.04 
 
 
192 aa  58.2  0.00000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  37.33 
 
 
72 aa  57.8  0.00000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  33.06 
 
 
128 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  34.21 
 
 
114 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  34.09 
 
 
749 aa  57  0.00000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  36.89 
 
 
152 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  38.36 
 
 
623 aa  56.2  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  38.24 
 
 
167 aa  57  0.0000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  34.04 
 
 
112 aa  56.2  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  35.29 
 
 
113 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  31.62 
 
 
116 aa  55.8  0.0000002  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  31.82 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  31.62 
 
 
116 aa  55.1  0.0000004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  33.33 
 
 
417 aa  55.1  0.0000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  35.8 
 
 
444 aa  55.1  0.0000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  31.82 
 
 
116 aa  54.7  0.0000005  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  32.22 
 
 
104 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  36.76 
 
 
113 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  44.16 
 
 
186 aa  54.7  0.0000005  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  38.55 
 
 
97 aa  54.3  0.0000006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  36.59 
 
 
120 aa  54.3  0.0000006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  38 
 
 
141 aa  54.3  0.0000006  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  30.77 
 
 
116 aa  54.3  0.0000007  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  31.82 
 
 
336 aa  54.3  0.0000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  32.89 
 
 
123 aa  53.9  0.0000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  31.11 
 
 
104 aa  53.9  0.0000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  29.91 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0533  hypothetical protein  35.23 
 
 
185 aa  53.1  0.000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.528363  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3424  hypothetical protein  38.82 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  37.33 
 
 
280 aa  53.1  0.000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  32 
 
 
109 aa  53.1  0.000001  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2695  hypothetical protein  29.63 
 
 
107 aa  53.5  0.000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945566  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  39.73 
 
 
239 aa  53.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  33.75 
 
 
112 aa  52  0.000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  34.41 
 
 
139 aa  51.6  0.000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  40 
 
 
347 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  35.44 
 
 
287 aa  51.2  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  27.36 
 
 
192 aa  51.2  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  39.08 
 
 
212 aa  50.8  0.000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  47.69 
 
 
318 aa  50.4  0.000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  38.16 
 
 
124 aa  50.4  0.000009  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  35.58 
 
 
173 aa  50.4  0.00001  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  32.18 
 
 
104 aa  50.1  0.00001  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  30.95 
 
 
113 aa  49.7  0.00002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  36.56 
 
 
139 aa  48.9  0.00003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
149 aa  48.5  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  28.97 
 
 
545 aa  48.9  0.00003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  37.18 
 
 
121 aa  48.1  0.00005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  35.64 
 
 
224 aa  47.8  0.00006  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  34.44 
 
 
235 aa  47  0.00009  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  32.99 
 
 
150 aa  47  0.00009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1421  hypothetical protein  30.71 
 
 
131 aa  47  0.0001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.753032  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  36.78 
 
 
209 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  35.21 
 
 
156 aa  47  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4791  putative amicyanin protein  38.98 
 
 
108 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0921378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  36.99 
 
 
315 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  35.62 
 
 
270 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3984  blue (type 1) copper domain protein  31.96 
 
 
139 aa  46.2  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0137128  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4880  putative amicyanin protein  32.47 
 
 
106 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.266193  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  28.44 
 
 
144 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  35.44 
 
 
179 aa  46.2  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  37.04 
 
 
210 aa  45.8  0.0002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1420  hypothetical protein  34.48 
 
 
131 aa  45.4  0.0003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>