38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_4791 on replicon NC_012848
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012848  Rleg_4791  putative amicyanin protein  100 
 
 		 108 aa  223  5.0000000000000005e-58  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0921378 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4880  putative amicyanin protein  83.65 
 
 		 106 aa  183  9e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.266193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3424  hypothetical protein  48.1 
 
 		 113 aa  87.4  6e-17  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  41 
 
 		 104 aa  84.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  38.82 
 
 		 113 aa  79  0.00000000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6437  hypothetical protein  34.34 
 
 		 107 aa  77  0.00000000000007  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1439  hypothetical protein  44.71 
 
 		 103 aa  77  0.00000000000007  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  44.93 
 
 		 105 aa  68.2  0.00000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  37.5 
 
 		 123 aa  66.6  0.0000000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2695  hypothetical protein  34.15 
 
 		 107 aa  65.9  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945566  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  39.51 
 
 		 264 aa  65.5  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  35.44 
 
 		 104 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  34.12 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 104 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  33.7 
 
 		 112 aa  55.5  0.0000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  32.05 
 
 		 85 aa  53.1  0.000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 117 aa  52  0.000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  32.53 
 
 		 97 aa  49.3  0.00002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  35.37 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  31.71 
 
 		 120 aa  48.5  0.00003  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  26.42 
 
 		 109 aa  46.6  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  27.78 
 
 		 109 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  38.89 
 
 		 157 aa  45.4  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  26.36 
 
 		 179 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  28.05 
 
 		 110 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  37.31 
 
 		 358 aa  44.7  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3140  hypothetical protein  31.86 
 
 		 458 aa  44.7  0.0005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.182787 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  26.25 
 
 		 124 aa  43.9  0.0008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  33.33 
 
 		 239 aa  43.5  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  29.27 
 
 		 167 aa  43.5  0.0009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  30.23 
 
 		 749 aa  43.5  0.001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  27.71 
 
 		 131 aa  42.7  0.002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0558  hypothetical protein  29.55 
 
 		 114 aa  41.2  0.005  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1195  hypothetical protein  32.81 
 
 		 372 aa  41.2  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 97 aa  40.8  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  34.88 
 
 		 119 aa  40.4  0.007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  25.56 
 
 		 119 aa  40.8  0.007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 116 aa  40.4  0.008  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>