60 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swit_3424 on replicon NC_009511
Organism: Sphingomonas wittichii RW1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009511  Swit_3424  hypothetical protein  100 
 
 		 113 aa  223  5.0000000000000005e-58  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4791  putative amicyanin protein  48.15 
 
 		 108 aa  89.4  2e-17  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0921378 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  42.71 
 
 		 104 aa  84.7  3e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4880  putative amicyanin protein  43.75 
 
 		 106 aa  82.4  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.266193  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  40.24 
 
 		 113 aa  76.6  0.0000000000001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6437  hypothetical protein  42.31 
 
 		 107 aa  72  0.000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  41.98 
 
 		 123 aa  70.5  0.000000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  39 
 
 		 105 aa  70.1  0.000000000009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  43.75 
 
 		 104 aa  68.6  0.00000000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  37.8 
 
 		 264 aa  66.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  41.25 
 
 		 104 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  38.46 
 
 		 85 aa  62.4  0.000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  40 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1439  hypothetical protein  33 
 
 		 103 aa  58.2  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2695  hypothetical protein  34.21 
 
 		 107 aa  57  0.00000008  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945566  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  38.96 
 
 		 157 aa  55.8  0.0000002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  40 
 
 		 117 aa  54.7  0.0000004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  31.17 
 
 		 97 aa  53.9  0.0000007  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  32.98 
 
 		 131 aa  53.5  0.0000008  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0060  hypothetical protein  37.35 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0072  hypothetical protein  37.35 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0071  plastocyanin/azurin family copper binding protein  37.35 
 
 		 99 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0088  plastocyanin/azurin family copper binding protein  37.35 
 
 		 100 aa  53.1  0.000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1499  hypothetical protein  37.35 
 
 		 124 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1216  hypothetical protein  37.35 
 
 		 116 aa  53.1  0.000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  36.67 
 
 		 179 aa  53.1  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1566  plastocyanin/azurin family copper binding protein  37.35 
 
 		 124 aa  53.5  0.000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  31.68 
 
 		 114 aa  52.4  0.000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  40.91 
 
 		 124 aa  50.8  0.000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  36.25 
 
 		 156 aa  50.4  0.000008  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  33.77 
 
 		 97 aa  50.1  0.000009  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 152 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  29.37 
 
 		 336 aa  48.9  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  29.81 
 
 		 109 aa  48.1  0.00004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  39.24 
 
 		 149 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  31.33 
 
 		 110 aa  47.8  0.00005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  30.77 
 
 		 120 aa  47.8  0.00006  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.27 
 
 		 749 aa  47  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 109 aa  46.2  0.0001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3984  blue (type 1) copper domain protein  34.18 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0137128  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  33.78 
 
 		 539 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  34.62 
 
 		 136 aa  45.4  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3022  secreted metal-binding protein  33.33 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3037  secreted metal-binding protein  33 
 
 		 138 aa  45.8  0.0002  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.198231  normal  0.144757 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3080  secreted metal-binding protein  33.33 
 
 		 138 aa  46.2  0.0002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  29.63 
 
 		 771 aa  45.4  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  31.18 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  29.03 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  30.56 
 
 		 72 aa  44.7  0.0005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  26.51 
 
 		 119 aa  43.5  0.0009  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  36.76 
 
 		 239 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  37.14 
 
 		 318 aa  43.5  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  35.29 
 
 		 444 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  29.87 
 
 		 417 aa  42.7  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  27.5 
 
 		 125 aa  42.7  0.002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  38.81 
 
 		 358 aa  41.6  0.003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  30.34 
 
 		 112 aa  42  0.003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  30.56 
 
 		 486 aa  41.6  0.004  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  34.18 
 
 		 116 aa  41.6  0.004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  23.15 
 
 		 111 aa  40.8  0.006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>