98 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caci_3576 on replicon NC_013131
Organism: Catenulispora acidiphila DSM 44928



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  100 
 
 		 156 aa  296  9e-80  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3984  blue (type 1) copper domain protein  54.49 
 
 		 139 aa  129  2.0000000000000002e-29  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0137128  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  62.35 
 
 		 149 aa  112  2.0000000000000002e-24  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3080  secreted metal-binding protein  37.18 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3022  secreted metal-binding protein  37.18 
 
 		 138 aa  76.3  0.0000000000002  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3037  secreted metal-binding protein  39.26 
 
 		 138 aa  74.7  0.0000000000004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.198231  normal  0.144757 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  43.75 
 
 		 123 aa  73.9  0.0000000000008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  38.27 
 
 		 124 aa  71.6  0.000000000004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  42.11 
 
 		 179 aa  69.7  0.00000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  41.98 
 
 		 104 aa  67  0.00000000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  40.51 
 
 		 97 aa  65.9  0.0000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  29.56 
 
 		 152 aa  65.9  0.0000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  44.05 
 
 		 136 aa  66.2  0.0000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  42.47 
 
 		 85 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  39.51 
 
 		 104 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  40.51 
 
 		 358 aa  59.3  0.00000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  39.76 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  37.84 
 
 		 444 aa  58.2  0.00000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  35.87 
 
 		 623 aa  57.4  0.00000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  35.8 
 
 		 110 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  38.46 
 
 		 120 aa  56.6  0.0000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  39.02 
 
 		 112 aa  56.6  0.0000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1499  hypothetical protein  38.46 
 
 		 124 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  35 
 
 		 114 aa  56.2  0.0000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0072  hypothetical protein  38.46 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1566  plastocyanin/azurin family copper binding protein  37.5 
 
 		 124 aa  56.2  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0060  hypothetical protein  38.46 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1216  hypothetical protein  38.46 
 
 		 116 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0088  plastocyanin/azurin family copper binding protein  37.5 
 
 		 100 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0071  plastocyanin/azurin family copper binding protein  37.5 
 
 		 99 aa  55.1  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  37.97 
 
 		 264 aa  55.1  0.0000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  37.04 
 
 		 318 aa  54.7  0.0000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  38.54 
 
 		 192 aa  54.7  0.0000005  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  40 
 
 		 72 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  40 
 
 		 104 aa  53.9  0.0000007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  35.37 
 
 		 117 aa  53.5  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  38.27 
 
 		 150 aa  53.5  0.000001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  31.46 
 
 		 336 aa  53.1  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  36.14 
 
 		 417 aa  52.8  0.000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  35.37 
 
 		 112 aa  52  0.000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2420  blue (type1) copper domain-containing protein  37.08 
 
 		 159 aa  52  0.000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  37.08 
 
 		 239 aa  51.6  0.000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  40.24 
 
 		 114 aa  50.8  0.000006  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2421  blue (type1) copper domain-containing protein  31.5 
 
 		 676 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  32.1 
 
 		 109 aa  50.8  0.000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  35.56 
 
 		 112 aa  50.8  0.000007  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  31.65 
 
 		 123 aa  50.8  0.000007  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  37.8 
 
 		 749 aa  50.4  0.000009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  30 
 
 		 105 aa  50.4  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  34.15 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  32.93 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  36.99 
 
 		 157 aa  49.7  0.00001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3424  hypothetical protein  36.25 
 
 		 113 aa  50.1  0.00001  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2634  blue (type 1) copper domain protein  30.69 
 
 		 140 aa  50.1  0.00001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  35.14 
 
 		 352 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2896  hypothetical protein  33.33 
 
 		 125 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 116 aa  49.7  0.00002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2773  hypothetical protein  35.06 
 
 		 123 aa  48.9  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0495  blue (type 1) copper domain protein  41.46 
 
 		 167 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0500  blue (type 1) copper domain  41.46 
 
 		 166 aa  48.9  0.00003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.177831  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 		 97 aa  48.5  0.00003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  36.25 
 
 		 130 aa  48.5  0.00004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  32.93 
 
 		 113 aa  48.5  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3000  hypothetical protein  35.06 
 
 		 123 aa  48.5  0.00004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0511761 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  33.75 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  33.75 
 
 		 112 aa  47.8  0.00005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  30.51 
 
 		 454 aa  47.8  0.00006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  36 
 
 		 270 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  32.41 
 
 		 315 aa  47.4  0.00008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1285  blue (type 1) copper domain protein  31.21 
 
 		 160 aa  47  0.00009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00926842  normal  0.753246 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  31.18 
 
 		 119 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0467  blue (type1) copper domain-containing protein  41.46 
 
 		 166 aa  46.6  0.0001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 		 539 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  32.93 
 
 		 456 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  34.57 
 
 		 110 aa  46.2  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  36.59 
 
 		 114 aa  46.2  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1100  blue (type 1) copper domain protein  26.82 
 
 		 673 aa  45.4  0.0003  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.303689  normal  0.203492 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6437  hypothetical protein  30.86 
 
 		 107 aa  45.4  0.0003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  33.33 
 
 		 131 aa  45.4  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  32.1 
 
 		 119 aa  45.1  0.0003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  39.68 
 
 		 301 aa  45.1  0.0004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  36.84 
 
 		 257 aa  45.1  0.0004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  36.26 
 
 		 139 aa  45.1  0.0004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  30.11 
 
 		 167 aa  44.7  0.0005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  34.25 
 
 		 107 aa  44.7  0.0005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  27.1 
 
 		 119 aa  43.9  0.0009  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  33.33 
 
 		 771 aa  42.7  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1439  hypothetical protein  30.21 
 
 		 103 aa  42.7  0.002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  35.38 
 
 		 126 aa  42.4  0.002  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  28.24 
 
 		 214 aa  42  0.003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  28.57 
 
 		 113 aa  41.6  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0004  hypothetical protein  30.38 
 
 		 298 aa  41.2  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  35.82 
 
 		 125 aa  41.2  0.005  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2695  hypothetical protein  30 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.945566  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  26.51 
 
 		 116 aa  41.2  0.006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4791  putative amicyanin protein  32.1 
 
 		 108 aa  40.8  0.007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0921378 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  27.48 
 
 		 224 aa  40.8  0.007  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0553  hypothetical protein  24.72 
 
 		 158 aa  40.4  0.009  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>