13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mkms_3080 on replicon NC_008705
Organism: Mycobacterium sp. KMS



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008146  Mmcs_3022  secreted metal-binding protein  100 
 
 		 138 aa  283  5e-76  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3080  secreted metal-binding protein  100 
 
 		 138 aa  283  5e-76  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3037  secreted metal-binding protein  94.2 
 
 		 138 aa  270  6e-72  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.198231  normal  0.144757 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  46.99 
 
 		 149 aa  75.9  0.0000000000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  46.91 
 
 		 156 aa  68.6  0.00000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3984  blue (type 1) copper domain protein  41.49 
 
 		 139 aa  67.4  0.00000000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0137128  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  35.8 
 
 		 124 aa  50.1  0.00001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1285  blue (type 1) copper domain protein  31.01 
 
 		 160 aa  47.4  0.00007  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.00926842  normal  0.753246 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  27.7 
 
 		 150 aa  43.9  0.0007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  30.53 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 120 aa  42.7  0.002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  37.31 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3424  hypothetical protein  33.75 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.167679 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>