120 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1443 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 
152 aa  312  9.999999999999999e-85  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  52.13 
 
 
318 aa  100  5e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  47.83 
 
 
239 aa  94.4  6e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  43.3 
 
 
315 aa  93.6  1e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1637  blue (type1) copper domain-containing protein  48.28 
 
 
623 aa  89.4  2e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  43.97 
 
 
358 aa  84.7  4e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  42.05 
 
 
287 aa  84  7e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0815  blue (type1) copper domain-containing protein  42.16 
 
 
539 aa  82.8  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.263519 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  47.13 
 
 
454 aa  78.6  0.00000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  40.74 
 
 
444 aa  72.4  0.000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1650  hypothetical protein  43.53 
 
 
270 aa  71.6  0.000000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  46.15 
 
 
97 aa  70.1  0.000000000009  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  40.91 
 
 
336 aa  69.7  0.00000000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  44.32 
 
 
280 aa  69.3  0.00000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1040  fibronectin type III domain-containing protein  40.91 
 
 
771 aa  65.1  0.0000000004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  39.47 
 
 
136 aa  64.3  0.0000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  36.84 
 
 
179 aa  62  0.000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  40.79 
 
 
417 aa  61.2  0.000000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  41.25 
 
 
119 aa  60.1  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0817  blue (type1) copper domain-containing protein  41.03 
 
 
97 aa  59.7  0.00000001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.737466  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1665  blue (type1) copper domain-containing protein  39.47 
 
 
167 aa  60.1  0.00000001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  38.67 
 
 
749 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  36.84 
 
 
114 aa  59.3  0.00000002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  36.84 
 
 
72 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  35.96 
 
 
486 aa  58.5  0.00000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  36.26 
 
 
156 aa  58.5  0.00000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  36.17 
 
 
109 aa  58.2  0.00000004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  35.53 
 
 
120 aa  58.2  0.00000004  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  36.62 
 
 
131 aa  57.8  0.00000006  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  38.2 
 
 
157 aa  56.2  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  38.16 
 
 
110 aa  56.6  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  37.66 
 
 
124 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 
112 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  36.84 
 
 
110 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  38.03 
 
 
119 aa  55.1  0.0000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  32.89 
 
 
114 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  35.53 
 
 
114 aa  55.1  0.0000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  35.53 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  35.53 
 
 
112 aa  54.3  0.0000006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  36 
 
 
150 aa  53.9  0.0000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1307  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 
174 aa  53.9  0.0000008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000740367 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  38.04 
 
 
116 aa  53.1  0.000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  34.72 
 
 
112 aa  53.1  0.000001  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  35.53 
 
 
113 aa  53.5  0.000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  36.84 
 
 
264 aa  52.8  0.000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  34.21 
 
 
113 aa  52.4  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  32.89 
 
 
104 aa  52.8  0.000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1921  blue (type1) copper domain-containing protein  40.54 
 
 
126 aa  52.8  0.000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1142  blue (type1) copper domain-containing protein  34.88 
 
 
153 aa  52.4  0.000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.036139 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  37.97 
 
 
111 aa  51.6  0.000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
192 aa  52  0.000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  36.84 
 
 
149 aa  52  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  35.53 
 
 
113 aa  51.6  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  32.89 
 
 
104 aa  51.6  0.000003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  32.65 
 
 
140 aa  51.6  0.000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  34.12 
 
 
173 aa  51.6  0.000004  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  39.19 
 
 
121 aa  51.6  0.000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  38.04 
 
 
116 aa  51.2  0.000005  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2298  beta-Ig-H3/fasciclin  32.04 
 
 
301 aa  50.8  0.000006  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  32.1 
 
 
230 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3984  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 
139 aa  50.8  0.000007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0137128  normal  0.368193 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2896  hypothetical protein  32.1 
 
 
125 aa  50.8  0.000007  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.06 
 
 
85 aa  49.7  0.00002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  40.51 
 
 
119 aa  48.9  0.00002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  32.95 
 
 
125 aa  48.9  0.00003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  33.33 
 
 
113 aa  48.9  0.00003  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1542  blue (type1) copper domain-containing protein  27.89 
 
 
154 aa  48.9  0.00003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000180556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2773  hypothetical protein  30.86 
 
 
123 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326615  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4790  blue (type1) copper domain-containing protein  31.51 
 
 
116 aa  48.5  0.00003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.339634  normal  0.129438 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  34.67 
 
 
117 aa  48.9  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0340  blue (type1) copper domain-containing protein  42.86 
 
 
130 aa  48.5  0.00003  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.143005 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  31.94 
 
 
352 aa  48.1  0.00004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0323  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
123 aa  48.5  0.00004  Methanococcus vannielii SB  Archaea  decreased coverage  0.00521297  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  36.84 
 
 
119 aa  48.1  0.00004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  34.21 
 
 
116 aa  48.1  0.00005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  35.87 
 
 
116 aa  48.1  0.00005  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3424  hypothetical protein  33.33 
 
 
113 aa  47.8  0.00005  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.185141  normal  0.167679 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  34.04 
 
 
127 aa  47.8  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  31.58 
 
 
545 aa  47.4  0.00007  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3000  hypothetical protein  29.63 
 
 
123 aa  47.4  0.00007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0511761 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  35.87 
 
 
116 aa  47  0.00009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  34.57 
 
 
112 aa  46.6  0.0001  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  31.71 
 
 
214 aa  47  0.0001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  33.78 
 
 
123 aa  46.6  0.0001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0060  hypothetical protein  30.26 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  29.89 
 
 
224 aa  45.8  0.0002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1195  hypothetical protein  38.03 
 
 
372 aa  46.2  0.0002  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1566  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.26 
 
 
124 aa  46.2  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  31.94 
 
 
192 aa  45.4  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1216  hypothetical protein  30.26 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1499  hypothetical protein  30.26 
 
 
124 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0072  hypothetical protein  30.26 
 
 
116 aa  45.8  0.0002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  23.16 
 
 
104 aa  45.4  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1161  hypothetical protein  29.41 
 
 
456 aa  46.2  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  29.73 
 
 
109 aa  45.8  0.0002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0088  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.26 
 
 
100 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0071  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.26 
 
 
99 aa  45.4  0.0003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  30.77 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  30.77 
 
 
119 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  23.96 
 
 
193 aa  44.7  0.0005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>