35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mchl_3000 on replicon NC_011757
Organism: Methylobacterium chloromethanicum CM4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011757  Mchl_3000  hypothetical protein  100 
 
 		 123 aa  252  9e-67  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0511761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2773  hypothetical protein  97.56 
 
 		 123 aa  247  4e-65  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2896  hypothetical protein  77.6 
 
 		 125 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4398  hypothetical protein  45.88 
 
 		 120 aa  84  6e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  32.41 
 
 		 107 aa  59.3  0.00000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  30.91 
 
 		 109 aa  50.1  0.00001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1499  hypothetical protein  29.27 
 
 		 124 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1566  plastocyanin/azurin family copper binding protein  29.27 
 
 		 124 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  28.26 
 
 		 109 aa  48.5  0.00003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0060  hypothetical protein  30.95 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  29.7 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0072  hypothetical protein  30.95 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1216  hypothetical protein  30.95 
 
 		 116 aa  48.1  0.00004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  29.63 
 
 		 152 aa  47.4  0.00007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0088  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.95 
 
 		 100 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0071  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.95 
 
 		 99 aa  46.6  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  30.19 
 
 		 444 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  30.95 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  35.06 
 
 		 156 aa  45.8  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  31.25 
 
 		 230 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  30.95 
 
 		 104 aa  45.1  0.0003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 116 aa  44.7  0.0004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  28.43 
 
 		 114 aa  44.7  0.0004  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  26.02 
 
 		 113 aa  44.3  0.0006  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  32.29 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.44 
 
 		 111 aa  43.1  0.001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  30.09 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  29.67 
 
 		 110 aa  42.4  0.002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  30.09 
 
 		 112 aa  42.7  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  29.67 
 
 		 113 aa  42.4  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  25.27 
 
 		 352 aa  41.6  0.003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  30.68 
 
 		 124 aa  41.6  0.003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  31.82 
 
 		 264 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  28.07 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>