44 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swoo_2377 on replicon NC_010506
Organism: Shewanella woodyi ATCC 51908



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  100 
 
 		 109 aa  221  4e-57  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  35.64 
 
 		 107 aa  75.5  0.0000000000002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  40.74 
 
 		 230 aa  71.6  0.000000000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  43.21 
 
 		 214 aa  64.3  0.0000000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  34.15 
 
 		 352 aa  58.9  0.00000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  31.58 
 
 		 218 aa  57.8  0.00000005  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  34.18 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  30.85 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000003  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  31.65 
 
 		 208 aa  54.7  0.0000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  32.29 
 
 		 227 aa  53.9  0.0000007  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  32.14 
 
 		 201 aa  53.5  0.0000009  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  53.1  0.000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  32.5 
 
 		 246 aa  53.5  0.000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  52  0.000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  33.73 
 
 		 216 aa  52.4  0.000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  33.77 
 
 		 223 aa  52  0.000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  33.33 
 
 		 225 aa  52  0.000003  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  32.63 
 
 		 223 aa  51.2  0.000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  32.58 
 
 		 240 aa  50.4  0.000007  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3000  hypothetical protein  30.91 
 
 		 123 aa  50.1  0.00001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0511761 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  31.65 
 
 		 224 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  33.33 
 
 		 232 aa  49.3  0.00002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2773  hypothetical protein  30 
 
 		 123 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326615  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  30.12 
 
 		 230 aa  48.1  0.00004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2896  hypothetical protein  28.57 
 
 		 125 aa  47  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4880  putative amicyanin protein  28.43 
 
 		 106 aa  46.6  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.266193  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  29.73 
 
 		 152 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  25.24 
 
 		 179 aa  45.1  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  32.47 
 
 		 150 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  26.09 
 
 		 264 aa  44.7  0.0004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  31.15 
 
 		 216 aa  44.7  0.0005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  30 
 
 		 210 aa  44.3  0.0006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  28.4 
 
 		 85 aa  43.5  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  33.78 
 
 		 113 aa  41.6  0.003  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4398  hypothetical protein  30.85 
 
 		 120 aa  42  0.003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  35.14 
 
 		 113 aa  42  0.003  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  32.43 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  27.5 
 
 		 202 aa  41.6  0.004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  32.43 
 
 		 112 aa  41.2  0.004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  32.43 
 
 		 112 aa  41.2  0.005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0215  putative amicyanin precursor protein  30 
 
 		 113 aa  40.4  0.007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  30.34 
 
 		 486 aa  40.4  0.008  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  31.17 
 
 		 114 aa  40.4  0.009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>