35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sden_0376 on replicon NC_007954
Organism: Shewanella denitrificans OS217



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  100 
 
 		 227 aa  466  9.999999999999999e-131  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  62.27 
 
 		 218 aa  282  4.0000000000000003e-75  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  60.91 
 
 		 225 aa  275  5e-73  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  60 
 
 		 225 aa  270  1e-71  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  60 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  59.55 
 
 		 225 aa  269  2.9999999999999997e-71  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  60.8 
 
 		 215 aa  261  6e-69  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  54.09 
 
 		 223 aa  258  5.0000000000000005e-68  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  45.16 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  43.88 
 
 		 224 aa  147  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  46.75 
 
 		 246 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  43.17 
 
 		 220 aa  142  6e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  43.95 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  55.36 
 
 		 208 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  42.68 
 
 		 202 aa  132  6e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  40.53 
 
 		 216 aa  129  5.0000000000000004e-29  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  41.08 
 
 		 232 aa  125  4.0000000000000003e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  44.23 
 
 		 210 aa  123  2e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  36.71 
 
 		 230 aa  122  4e-27  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  54.35 
 
 		 240 aa  115  6e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  30.29 
 
 		 223 aa  106  2e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  36.13 
 
 		 236 aa  102  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  33.17 
 
 		 214 aa  99  5e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  30.64 
 
 		 230 aa  98.6  7e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  34 
 
 		 193 aa  98.2  8e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  39.01 
 
 		 201 aa  93.6  2e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  31 
 
 		 218 aa  86.7  3e-16  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  30.66 
 
 		 224 aa  73.6  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 239 aa  71.6  0.000000000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  31.25 
 
 		 352 aa  70.5  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  26.14 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  32.29 
 
 		 109 aa  53.9  0.000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  27.95 
 
 		 257 aa  53.5  0.000002  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  26.06 
 
 		 237 aa  52.4  0.000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5895  hypothetical protein  55.56 
 
 		 343 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>