33 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0912 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  100 
 
 		 236 aa  492  9.999999999999999e-139  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  44.39 
 
 		 223 aa  183  3e-45  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  43.08 
 
 		 193 aa  175  5e-43  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  28.81 
 
 		 216 aa  115  6.9999999999999995e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  32.21 
 
 		 208 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  29.28 
 
 		 225 aa  106  3e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  33.54 
 
 		 230 aa  106  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  34.9 
 
 		 202 aa  105  4e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  29.28 
 
 		 225 aa  105  7e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  31.91 
 
 		 215 aa  105  7e-22  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  28.73 
 
 		 225 aa  103  2e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  33.33 
 
 		 246 aa  103  3e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  28.73 
 
 		 225 aa  102  4e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  36.13 
 
 		 227 aa  102  5e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  37.5 
 
 		 218 aa  99.8  3e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  34.44 
 
 		 216 aa  100  3e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  27.66 
 
 		 223 aa  99  6e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  33.33 
 
 		 220 aa  98.2  1e-19  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  37.5 
 
 		 232 aa  95.9  6e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  33.06 
 
 		 223 aa  92.4  5e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  30.2 
 
 		 224 aa  90.5  2e-17  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  34.45 
 
 		 210 aa  79  0.00000000000007  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  25.25 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  28.34 
 
 		 240 aa  77  0.0000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  25.87 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  28.89 
 
 		 218 aa  74.3  0.000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  26.92 
 
 		 201 aa  72  0.000000000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  29.34 
 
 		 214 aa  70.1  0.00000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  26.83 
 
 		 352 aa  67  0.0000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  27.52 
 
 		 237 aa  65.5  0.0000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  26.47 
 
 		 257 aa  58.5  0.00000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  24.46 
 
 		 239 aa  51.2  0.00001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  30.88 
 
 		 245 aa  49.7  0.00004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>