35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shewmr4_1076 on replicon NC_008321
Organism: Shewanella sp. MR-4



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  100 
 
 		 215 aa  445  1.0000000000000001e-124  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  76.61 
 
 		 225 aa  348  4e-95  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  76.15 
 
 		 225 aa  347  6e-95  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  75.69 
 
 		 225 aa  344  5e-94  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  75.69 
 
 		 225 aa  344  5e-94  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  72.48 
 
 		 218 aa  342  2.9999999999999997e-93  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  60.8 
 
 		 227 aa  261  6e-69  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  59.33 
 
 		 223 aa  253  1.0000000000000001e-66  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  45.5 
 
 		 224 aa  152  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  43.92 
 
 		 223 aa  152  4e-36  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  47.44 
 
 		 246 aa  142  4e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  37.19 
 
 		 216 aa  142  5e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  47.65 
 
 		 220 aa  140  9.999999999999999e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  43.48 
 
 		 202 aa  132  3.9999999999999996e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  49.11 
 
 		 208 aa  128  8.000000000000001e-29  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  35.44 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  40.44 
 
 		 216 aa  122  3e-27  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  38.1 
 
 		 232 aa  117  1.9999999999999998e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  42.65 
 
 		 210 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  41.1 
 
 		 230 aa  112  3e-24  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  31.91 
 
 		 236 aa  105  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  31.18 
 
 		 223 aa  103  3e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  29.79 
 
 		 230 aa  97.4  1e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  36.15 
 
 		 214 aa  93.2  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  30.56 
 
 		 193 aa  93.6  2e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  32.39 
 
 		 201 aa  88.6  6e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  33.16 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  29.82 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  28.68 
 
 		 224 aa  65.9  0.0000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  32.14 
 
 		 239 aa  59.7  0.00000004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  30.85 
 
 		 109 aa  55.5  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  26.14 
 
 		 257 aa  50.1  0.00003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  26.36 
 
 		 245 aa  48.1  0.00009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  21.38 
 
 		 237 aa  46.6  0.0003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  30.38 
 
 		 107 aa  42.7  0.004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>