35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_0257 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  100 
 
 		 240 aa  499  1e-140  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  49.36 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  43.09 
 
 		 246 aa  149  4e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  48.28 
 
 		 224 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  46.85 
 
 		 223 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  45.33 
 
 		 202 aa  142  3e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  45.22 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  42.21 
 
 		 220 aa  128  9.000000000000001e-29  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  40.72 
 
 		 225 aa  125  4.0000000000000003e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  35.44 
 
 		 215 aa  125  9e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  40.36 
 
 		 225 aa  124  1e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  39.76 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  40.36 
 
 		 225 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  36.76 
 
 		 208 aa  121  9.999999999999999e-27  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  45.86 
 
 		 218 aa  119  3e-26  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  36.99 
 
 		 230 aa  117  1.9999999999999998e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  54.35 
 
 		 227 aa  115  6.9999999999999995e-25  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  43.66 
 
 		 216 aa  113  3e-24  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  34.73 
 
 		 216 aa  110  3e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  36 
 
 		 223 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  30.17 
 
 		 223 aa  92  8e-18  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  32.32 
 
 		 193 aa  90.1  3e-17  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  28.34 
 
 		 236 aa  77  0.0000000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  32.95 
 
 		 201 aa  74.3  0.000000000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  33.58 
 
 		 214 aa  70.9  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  30.43 
 
 		 218 aa  69.7  0.00000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  30.28 
 
 		 230 aa  68.2  0.0000000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  22.63 
 
 		 352 aa  55.8  0.0000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  32.58 
 
 		 109 aa  50.4  0.00002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  27.73 
 
 		 224 aa  49.3  0.00005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  26.53 
 
 		 237 aa  48.5  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  34.04 
 
 		 107 aa  47  0.0003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  25.95 
 
 		 245 aa  44.7  0.001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  24.49 
 
 		 257 aa  44.7  0.001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  29.55 
 
 		 239 aa  43.9  0.002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>