35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PXO_01277 on replicon NC_010717
Organism: Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  100 
 
 
216 aa  437  9.999999999999999e-123  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  42.86 
 
 
223 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  50.3 
 
 
220 aa  153  2e-36  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  44.75 
 
 
230 aa  151  8.999999999999999e-36  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  50.6 
 
 
246 aa  147  9e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  47.7 
 
 
232 aa  142  6e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  45.56 
 
 
208 aa  138  4.999999999999999e-32  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  50.34 
 
 
224 aa  137  1e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  41.07 
 
 
202 aa  136  2e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  50.36 
 
 
223 aa  134  7.000000000000001e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  43.35 
 
 
227 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  43.33 
 
 
216 aa  132  5e-30  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  38.91 
 
 
225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  38.46 
 
 
225 aa  129  4.0000000000000003e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  38.46 
 
 
225 aa  129  5.0000000000000004e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  39.5 
 
 
215 aa  127  1.0000000000000001e-28  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  38.46 
 
 
225 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  38.71 
 
 
218 aa  123  2e-27  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  40.68 
 
 
210 aa  122  3e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  41.86 
 
 
240 aa  116  3e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  32.22 
 
 
223 aa  104  1e-21  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  34.44 
 
 
236 aa  100  1e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  36.23 
 
 
193 aa  96.3  3e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  33.33 
 
 
230 aa  92.4  5e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  33.76 
 
 
201 aa  89  5e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  42.42 
 
 
214 aa  88.2  8e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  35.4 
 
 
237 aa  69.3  0.00000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  30.99 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  34.39 
 
 
245 aa  64.3  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  32.1 
 
 
257 aa  62.8  0.000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  35.29 
 
 
218 aa  62  0.000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  30.83 
 
 
352 aa  60.8  0.00000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  31.76 
 
 
239 aa  56.6  0.0000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  31.15 
 
 
109 aa  44.7  0.001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
150 aa  41.6  0.009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>