32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_3163 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  100 
 
 
218 aa  441  1e-123  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  35.08 
 
 
220 aa  86.7  2e-16  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  31 
 
 
227 aa  86.7  2e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  31.75 
 
 
230 aa  82.4  0.000000000000005  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  29.5 
 
 
202 aa  81.6  0.000000000000008  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  33.93 
 
 
225 aa  80.5  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  33.33 
 
 
225 aa  79.3  0.00000000000004  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  33.16 
 
 
215 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  32.74 
 
 
225 aa  77.8  0.0000000000001  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  32.74 
 
 
225 aa  76.6  0.0000000000003  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  29.27 
 
 
223 aa  75.5  0.0000000000006  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  30.69 
 
 
218 aa  75.1  0.0000000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  28.89 
 
 
236 aa  75.1  0.0000000000008  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  33 
 
 
216 aa  74.7  0.0000000000009  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  26.34 
 
 
223 aa  74.3  0.000000000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  38.46 
 
 
232 aa  73.6  0.000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  33.73 
 
 
224 aa  73.2  0.000000000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  33.33 
 
 
208 aa  72.4  0.000000000004  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  26.88 
 
 
193 aa  72.4  0.000000000005  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  31.48 
 
 
223 aa  70.5  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  30.43 
 
 
240 aa  69.7  0.00000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  32.77 
 
 
246 aa  66.2  0.0000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  32.52 
 
 
210 aa  63.9  0.000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  29.95 
 
 
230 aa  62.4  0.000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  29.35 
 
 
201 aa  58.5  0.00000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  34.13 
 
 
216 aa  55.8  0.0000005  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  26.77 
 
 
239 aa  47  0.0002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  26.79 
 
 
257 aa  46.6  0.0003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  25.74 
 
 
245 aa  45.8  0.0006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  25.95 
 
 
237 aa  43.5  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  24.24 
 
 
224 aa  42.7  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  23.78 
 
 
352 aa  42.7  0.005  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>