37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A0215 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  100 
 
 		 220 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  51.18 
 
 		 208 aa  168  6e-41  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  56.2 
 
 		 246 aa  156  3e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  48.19 
 
 		 224 aa  154  1e-36  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  46.99 
 
 		 223 aa  153  2e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  48.55 
 
 		 216 aa  152  4e-36  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  46.36 
 
 		 218 aa  148  6e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  41.42 
 
 		 202 aa  146  3e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  50.71 
 
 		 223 aa  145  5e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  41.75 
 
 		 227 aa  144  8.000000000000001e-34  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  48.32 
 
 		 225 aa  144  1e-33  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  45.7 
 
 		 210 aa  143  2e-33  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  48.32 
 
 		 225 aa  142  3e-33  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  49.39 
 
 		 232 aa  142  3e-33  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  45.96 
 
 		 215 aa  142  4e-33  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  48.32 
 
 		 225 aa  142  4e-33  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  47.65 
 
 		 225 aa  141  7e-33  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  50.34 
 
 		 216 aa  140  9.999999999999999e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  39.56 
 
 		 230 aa  139  4.999999999999999e-32  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  38.12 
 
 		 240 aa  132  5e-30  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  32.43 
 
 		 223 aa  111  9e-24  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  38.36 
 
 		 230 aa  102  5e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  31.33 
 
 		 236 aa  99.4  4e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  34.13 
 
 		 193 aa  99  5e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  40.98 
 
 		 214 aa  94.7  1e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  34.98 
 
 		 218 aa  88.2  9e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  38.97 
 
 		 201 aa  87.8  1e-16  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  32.39 
 
 		 224 aa  72  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  28.57 
 
 		 352 aa  63.5  0.000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  32.61 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  34.18 
 
 		 109 aa  57.4  0.0000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  25.41 
 
 		 237 aa  56.2  0.0000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  31.94 
 
 		 257 aa  54.7  0.000001  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  29.03 
 
 		 245 aa  51.6  0.000009  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  28.85 
 
 		 107 aa  44.3  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  34.13 
 
 		 417 aa  43.1  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  36.36 
 
 		 179 aa  42.4  0.006  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>