37 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Shew185_3179 on replicon NC_009665
Organism: Shewanella baltica OS185



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  100 
 
 
225 aa  462  1e-129  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  97.78 
 
 
225 aa  454  1e-127  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  97.78 
 
 
225 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  97.78 
 
 
225 aa  455  1e-127  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  76.61 
 
 
215 aa  348  5e-95  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  72.48 
 
 
218 aa  340  1e-92  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  60.91 
 
 
227 aa  275  5e-73  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  58.6 
 
 
223 aa  263  1e-69  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  41.71 
 
 
223 aa  144  8.000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  38.71 
 
 
224 aa  143  2e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  48.32 
 
 
220 aa  144  2e-33  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  52.55 
 
 
246 aa  142  3e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  40.68 
 
 
202 aa  135  7.000000000000001e-31  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  48.33 
 
 
208 aa  132  3e-30  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  41.06 
 
 
216 aa  129  3e-29  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  40.72 
 
 
240 aa  125  4.0000000000000003e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  41.27 
 
 
216 aa  124  9e-28  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  38.57 
 
 
210 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  45.45 
 
 
232 aa  119  3e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  37.08 
 
 
230 aa  111  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  28.73 
 
 
236 aa  103  3e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  30.36 
 
 
223 aa  101  1e-20  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  31.12 
 
 
201 aa  100  2e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  35.1 
 
 
193 aa  97.8  1e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  38.64 
 
 
214 aa  96.7  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  30.98 
 
 
230 aa  94.7  9e-19  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  27.09 
 
 
352 aa  80.5  0.00000000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  33.93 
 
 
218 aa  80.5  0.00000000000002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  33.86 
 
 
239 aa  68.6  0.00000000008  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  33.63 
 
 
224 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  28.16 
 
 
257 aa  61.6  0.000000008  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  24.16 
 
 
245 aa  54.3  0.000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 
109 aa  53.1  0.000003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  22.93 
 
 
237 aa  51.2  0.00001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  31.65 
 
 
107 aa  43.5  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  32.95 
 
 
179 aa  43.1  0.003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5895  hypothetical protein  44.12 
 
 
343 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>