40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Aave_4293 on replicon NC_008752
Organism: Acidovorax citrulli AAC00-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  100 
 
 		 208 aa  415  9.999999999999999e-116  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  51.18 
 
 		 220 aa  169  4e-41  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  52.03 
 
 		 224 aa  156  2e-37  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  49.65 
 
 		 223 aa  150  1e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  49.67 
 
 		 246 aa  150  1e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  40.96 
 
 		 202 aa  150  1e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  45.96 
 
 		 223 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  47.13 
 
 		 227 aa  142  4e-33  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  44.3 
 
 		 230 aa  141  6e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  45.56 
 
 		 216 aa  138  4.999999999999999e-32  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  36.06 
 
 		 223 aa  136  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  40.24 
 
 		 218 aa  134  7.000000000000001e-31  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  46.71 
 
 		 216 aa  133  9.999999999999999e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  48.33 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  47.5 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  47.5 
 
 		 225 aa  130  1.0000000000000001e-29  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  47.5 
 
 		 225 aa  130  2.0000000000000002e-29  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  40.11 
 
 		 232 aa  129  4.0000000000000003e-29  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  40.99 
 
 		 215 aa  128  5.0000000000000004e-29  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  46.26 
 
 		 210 aa  127  1.0000000000000001e-28  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  34.78 
 
 		 240 aa  125  7e-28  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  29.76 
 
 		 236 aa  112  3e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  33.72 
 
 		 193 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  39.29 
 
 		 214 aa  97.1  2e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  34.03 
 
 		 201 aa  92.8  3e-18  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  39.09 
 
 		 230 aa  91.7  8e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  33.16 
 
 		 218 aa  79.3  0.00000000000004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 239 aa  73.2  0.000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  36.7 
 
 		 224 aa  72.4  0.000000000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  25.87 
 
 		 237 aa  67.4  0.0000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  27.52 
 
 		 352 aa  66.2  0.0000000003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  33.33 
 
 		 245 aa  65.5  0.0000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  27.81 
 
 		 257 aa  55.5  0.0000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  31.65 
 
 		 109 aa  55.1  0.0000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  30.16 
 
 		 150 aa  46.2  0.0003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  30.86 
 
 		 107 aa  46.2  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  27.5 
 
 		 152 aa  42.7  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  29.63 
 
 		 318 aa  42.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0185  blue (type1) copper domain-containing protein  30.86 
 
 		 315 aa  42.4  0.005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.312922 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3511  hypothetical protein  35.44 
 
 		 926 aa  42  0.007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.45252 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>