38 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene MADE_03562 on replicon NC_011138
Organism: Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  100 
 
 		 230 aa  481  1e-135  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  42.13 
 
 		 202 aa  171  1e-41  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  48.03 
 
 		 246 aa  152  4e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  46.01 
 
 		 216 aa  146  3e-34  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  43.87 
 
 		 224 aa  139  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  45.27 
 
 		 208 aa  136  3.0000000000000003e-31  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  36.02 
 
 		 216 aa  135  4e-31  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  50.86 
 
 		 223 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  43.45 
 
 		 220 aa  134  1.9999999999999998e-30  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  33.65 
 
 		 223 aa  126  3e-28  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  48.74 
 
 		 232 aa  125  8.000000000000001e-28  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  37.31 
 
 		 210 aa  124  1e-27  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  41.25 
 
 		 223 aa  124  1e-27  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  36.71 
 
 		 227 aa  122  4e-27  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  36.99 
 
 		 240 aa  117  1.9999999999999998e-25  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  33.97 
 
 		 218 aa  114  1.0000000000000001e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  38.07 
 
 		 225 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  41.1 
 
 		 215 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  38.07 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  38.07 
 
 		 225 aa  112  4.0000000000000004e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  37.08 
 
 		 225 aa  111  1.0000000000000001e-23  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  32.22 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  33.54 
 
 		 236 aa  106  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  34.48 
 
 		 201 aa  90.5  2e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  28.28 
 
 		 230 aa  89  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  36.67 
 
 		 214 aa  83.2  0.000000000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  31.75 
 
 		 218 aa  82.4  0.000000000000006  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  32.12 
 
 		 245 aa  75.5  0.0000000000006  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  27.04 
 
 		 352 aa  70.9  0.00000000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  32.79 
 
 		 239 aa  68.2  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  29.66 
 
 		 224 aa  67.4  0.0000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  30.89 
 
 		 237 aa  62  0.000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  33.94 
 
 		 257 aa  59.3  0.00000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  32.1 
 
 		 152 aa  50.8  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  30.12 
 
 		 109 aa  48.1  0.0001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  29.27 
 
 		 318 aa  42.4  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  32.93 
 
 		 136 aa  42  0.009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1250  protease inhibitor Kazal-type  31.65 
 
 		 239 aa  41.6  0.009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>