34 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_3361 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  419  1e-116  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  42.13 
 
 		 230 aa  171  7.999999999999999e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  53.42 
 
 		 224 aa  160  2e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  53.42 
 
 		 223 aa  154  7e-37  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  51.28 
 
 		 246 aa  154  8e-37  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  41.9 
 
 		 208 aa  147  7e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  42.77 
 
 		 220 aa  145  3e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  45.33 
 
 		 240 aa  142  2e-33  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  42.86 
 
 		 216 aa  141  8e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  40.68 
 
 		 225 aa  135  5e-31  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  44.22 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  39.66 
 
 		 225 aa  134  9.999999999999999e-31  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  38.46 
 
 		 210 aa  133  9.999999999999999e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  53.78 
 
 		 232 aa  134  9.999999999999999e-31  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  39.66 
 
 		 225 aa  133  1.9999999999999998e-30  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  39.66 
 
 		 225 aa  132  3e-30  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  38.31 
 
 		 223 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  43.48 
 
 		 215 aa  132  3.9999999999999996e-30  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  42.68 
 
 		 227 aa  132  5e-30  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  38.55 
 
 		 218 aa  130  9e-30  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  36.73 
 
 		 223 aa  128  7.000000000000001e-29  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  37.84 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  34.9 
 
 		 236 aa  105  3e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  33.75 
 
 		 201 aa  97.1  1e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  28.57 
 
 		 230 aa  88.6  6e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  38.35 
 
 		 214 aa  88.2  9e-17  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  37.59 
 
 		 224 aa  85.1  6e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  29.5 
 
 		 218 aa  81.6  0.000000000000007  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  36.76 
 
 		 239 aa  74.3  0.000000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  30.28 
 
 		 245 aa  63.9  0.000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  26.34 
 
 		 257 aa  63.2  0.000000003  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  27.27 
 
 		 237 aa  62  0.000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  29.36 
 
 		 352 aa  57  0.0000002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  27.5 
 
 		 109 aa  41.6  0.009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>