40 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sde_3945 on replicon NC_007912
Organism: Saccharophagus degradans 2-40



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  100 
 
 		 352 aa  728    Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  27.72 
 
 		 230 aa  89.4  9e-17  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  26.84 
 
 		 225 aa  82  0.00000000000001  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  26.6 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  27.09 
 
 		 225 aa  80.5  0.00000000000005  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  26.6 
 
 		 225 aa  79.3  0.00000000000009  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  26.58 
 
 		 223 aa  78.2  0.0000000000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  32.39 
 
 		 246 aa  78.2  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  31.58 
 
 		 201 aa  76.6  0.0000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  27.47 
 
 		 216 aa  76.3  0.0000000000007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  32.2 
 
 		 218 aa  75.5  0.000000000001  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  27.81 
 
 		 214 aa  71.6  0.00000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  27.04 
 
 		 230 aa  70.9  0.00000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  31.25 
 
 		 227 aa  70.5  0.00000000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  32.03 
 
 		 224 aa  68.9  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  26.83 
 
 		 236 aa  67.4  0.0000000003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  27.52 
 
 		 208 aa  66.6  0.0000000007  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  29.82 
 
 		 215 aa  66.2  0.0000000009  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  28 
 
 		 224 aa  65.1  0.000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  28.57 
 
 		 220 aa  63.2  0.000000006  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  25.33 
 
 		 223 aa  63.2  0.000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  27.03 
 
 		 223 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  30.83 
 
 		 216 aa  60.8  0.00000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  34.15 
 
 		 109 aa  58.9  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  22.22 
 
 		 193 aa  58.2  0.0000002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  29.36 
 
 		 202 aa  57  0.0000005  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  27.89 
 
 		 245 aa  55.8  0.000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  30.59 
 
 		 210 aa  55.5  0.000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  22.63 
 
 		 240 aa  55.8  0.000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  29.76 
 
 		 107 aa  53.5  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  25 
 
 		 232 aa  51.2  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  31.94 
 
 		 152 aa  48.1  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  31.18 
 
 		 239 aa  47.8  0.0003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  33.75 
 
 		 156 aa  47.4  0.0004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  27.2 
 
 		 257 aa  47  0.0005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  27.27 
 
 		 112 aa  46.6  0.0006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  32.43 
 
 		 112 aa  46.2  0.0008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  30 
 
 		 264 aa  44.3  0.003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1439  hypothetical protein  28.89 
 
 		 103 aa  43.5  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  29.63 
 
 		 117 aa  42.7  0.01  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>