35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_4209 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_4209  hypothetical protein  100 
 
 		 223 aa  459  9.999999999999999e-129  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3943  hypothetical protein  82.14 
 
 		 224 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00343132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1226  hypothetical protein  60.53 
 
 		 246 aa  222  4e-57  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.798149  normal  0.0905883 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3908  hypothetical protein  42.08 
 
 		 223 aa  162  5.0000000000000005e-39  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3114  hypothetical protein  40.83 
 
 		 218 aa  157  2e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.0701367 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3361  hypothetical protein  51.63 
 
 		 202 aa  156  2e-37  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.971869  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1076  hypothetical protein  41.12 
 
 		 215 aa  155  5.0000000000000005e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3179  hypothetical protein  39.65 
 
 		 225 aa  151  7e-36  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0376  hypothetical protein  43.07 
 
 		 227 aa  151  8e-36  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4293  hypothetical protein  49.65 
 
 		 208 aa  150  1e-35  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3180  hypothetical protein  39.21 
 
 		 225 aa  149  5e-35  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.695227  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3323  hypothetical protein  39.21 
 
 		 225 aa  148  7e-35  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1191  hypothetical protein  39.21 
 
 		 225 aa  147  9e-35  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0257  hypothetical protein  43.56 
 
 		 240 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0215  hypothetical protein  50.71 
 
 		 220 aa  145  5e-34  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.929627  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03562  putative secreted protein  43.27 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0077  hypothetical protein  45.7 
 
 		 216 aa  142  6e-33  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.132463 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1239  hypothetical protein  49.23 
 
 		 232 aa  140  1.9999999999999998e-32  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01277  hypothetical protein  50.36 
 
 		 216 aa  135  6.0000000000000005e-31  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0382358  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1807  hypothetical protein  48.85 
 
 		 210 aa  130  1.0000000000000001e-29  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2946  hypothetical protein  30.43 
 
 		 223 aa  117  9.999999999999999e-26  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1417  hypothetical protein  33.11 
 
 		 193 aa  107  1e-22  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.99203  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0912  hypothetical protein  28.02 
 
 		 236 aa  96.7  3e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.815852  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0650  hypothetical protein  38.81 
 
 		 201 aa  96.7  3e-19  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.103129  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1615  hypothetical protein  38.93 
 
 		 214 aa  95.1  8e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.711179 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  31.97 
 
 		 230 aa  79  0.00000000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3163  hypothetical protein  32.24 
 
 		 218 aa  77.8  0.0000000000001  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.541529  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0947  putative lipoprotein  31.21 
 
 		 224 aa  76.3  0.0000000000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.639901 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0436  hypothetical protein  31.93 
 
 		 237 aa  75.1  0.0000000000007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0471891 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5058  putative lipoprotein  33.9 
 
 		 245 aa  72  0.000000000007  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2853  putative lipoprotein  34.29 
 
 		 239 aa  67.8  0.0000000001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00348073 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  27.03 
 
 		 352 aa  62  0.000000006  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3310  hypothetical protein  29.31 
 
 		 257 aa  58.9  0.00000007  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.481404  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  33.77 
 
 		 109 aa  52  0.000007  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  26.85 
 
 		 318 aa  42  0.008  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>