39 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpop_2896 on replicon NC_010725
Organism: Methylobacterium populi BJ001



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010725  Mpop_2896  hypothetical protein  100 
 
 		 125 aa  253  7e-67  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3000  hypothetical protein  77.6 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0511761 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2773  hypothetical protein  77.6 
 
 		 123 aa  199  9.999999999999999e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326615  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4398  hypothetical protein  47.67 
 
 		 120 aa  87.4  5e-17  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.500571 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7509  putative blue (type 1) copper protein  37.63 
 
 		 107 aa  68.6  0.00000000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.344279  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  30.1 
 
 		 109 aa  58.2  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  32.1 
 
 		 152 aa  50.8  0.000007  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  28.21 
 
 		 179 aa  48.1  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3576  blue (type 1) copper domain protein  33.33 
 
 		 156 aa  47.8  0.00005  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.384715  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  32.14 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  32.43 
 
 		 264 aa  47.4  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3976  blue (type 1) copper domain protein  34.67 
 
 		 149 aa  47.4  0.00007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.262484  normal  0.466824 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2377  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 109 aa  47  0.00009  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0230542  normal  0.405359 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1499  hypothetical protein  32.14 
 
 		 124 aa  47  0.00009  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0072  hypothetical protein  32.14 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0060  hypothetical protein  32.14 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1216  hypothetical protein  32.14 
 
 		 116 aa  47  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  32.56 
 
 		 104 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1566  plastocyanin/azurin family copper binding protein  32.14 
 
 		 124 aa  46.2  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0088  plastocyanin/azurin family copper binding protein  32.14 
 
 		 100 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0071  plastocyanin/azurin family copper binding protein  32.14 
 
 		 99 aa  45.8  0.0002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  30.86 
 
 		 111 aa  44.7  0.0004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0518  hypothetical protein  30 
 
 		 230 aa  43.9  0.0007  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0762654  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1354  multicopper oxidase type 3  29.47 
 
 		 444 aa  43.1  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.111259 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  27.1 
 
 		 116 aa  43.1  0.001  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  28.85 
 
 		 114 aa  43.5  0.001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  30.77 
 
 		 114 aa  42.7  0.002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3945  hypothetical protein  26.37 
 
 		 352 aa  42.4  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.488584  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  28.72 
 
 		 114 aa  41.6  0.003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  30.77 
 
 		 110 aa  42  0.003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  30.43 
 
 		 104 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  28.18 
 
 		 119 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3177  blue (type 1) copper domain protein  30.68 
 
 		 124 aa  41.6  0.004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  29.67 
 
 		 113 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  27.27 
 
 		 336 aa  40.8  0.006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  31.08 
 
 		 157 aa  40.8  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  30.23 
 
 		 112 aa  40.8  0.006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  31.17 
 
 		 117 aa  40.4  0.007  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0004  hypothetical protein  29.41 
 
 		 298 aa  40  0.01  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>