75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CPS_0599 on replicon NC_003910
Organism: Colwellia psychrerythraea 34H



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  100 
 
 		 111 aa  231  3e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  43.4 
 
 		 116 aa  89.7  1e-17  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  43.4 
 
 		 109 aa  77.4  0.00000000000006  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0345  blue (type 1) copper domain protein  36.96 
 
 		 119 aa  61.6  0.000000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0227778 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  40.95 
 
 		 128 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  41.51 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  40.74 
 
 		 116 aa  60.8  0.000000006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  39.13 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0146  blue (type 1) copper domain protein  36.67 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  38.68 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  38.24 
 
 		 116 aa  58.9  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  40.57 
 
 		 116 aa  59.3  0.00000002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  38.89 
 
 		 116 aa  57.8  0.00000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  37.25 
 
 		 116 aa  57  0.00000008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  32.63 
 
 		 131 aa  57  0.00000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  31.36 
 
 		 125 aa  53.9  0.0000008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  33.33 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  33.33 
 
 		 119 aa  53.1  0.000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3197  peptidase S8/S53 subtilisin kexin sedolisin  29.67 
 
 		 749 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0061261  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 		 150 aa  51.6  0.000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  37.97 
 
 		 152 aa  51.6  0.000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  29.81 
 
 		 114 aa  52  0.000003  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  35.85 
 
 		 126 aa  51.2  0.000004  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  30.53 
 
 		 336 aa  50.8  0.000005  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1286  copper binding protein, plastocyanin  26.73 
 
 		 192 aa  50.8  0.000006  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.232717  normal  0.839304 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  30.77 
 
 		 127 aa  50.8  0.000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5325  blue (type 1) copper domain protein  33.75 
 
 		 114 aa  50.8  0.000007  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.261789  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2525  blue (type 1) copper domain protein  28.57 
 
 		 179 aa  50.1  0.000009  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.197814  normal  0.378736 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  34.26 
 
 		 119 aa  50.1  0.00001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1273  blue (type1) copper domain-containing protein  32.18 
 
 		 287 aa  49.3  0.00002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.367942 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  31.46 
 
 		 110 aa  49.7  0.00002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1272  hypothetical protein  30.61 
 
 		 114 aa  49.3  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.22418  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  32.91 
 
 		 417 aa  48.9  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  30.3 
 
 		 105 aa  48.1  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  30 
 
 		 264 aa  47.8  0.00006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4142  blue (type1) copper domain-containing protein  32.1 
 
 		 113 aa  47.4  0.00008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.470905 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0721  blue (type 1) copper domain protein  20.59 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4608  blue (type1) copper domain-containing protein  32.1 
 
 		 113 aa  46.2  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.811834 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2773  hypothetical protein  30.28 
 
 		 123 aa  46.6  0.0001  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.326615  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  25.89 
 
 		 137 aa  47  0.0001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4760  blue (type1) copper domain-containing protein  32.1 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  0.205378 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3607  blue (type1) copper domain-containing protein  32.1 
 
 		 112 aa  46.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.400265  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5523  blue (type1) copper domain-containing protein  32.1 
 
 		 112 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.736304 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0968  plastocyanin  29.27 
 
 		 110 aa  45.8  0.0002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.330808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  32.18 
 
 		 120 aa  45.4  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  28.57 
 
 		 136 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0918  hypothetical protein  32.05 
 
 		 280 aa  45.1  0.0004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3897  blue (type1) copper domain-containing protein  29.63 
 
 		 113 aa  44.7  0.0004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.591713  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0925  blue (type1) copper domain-containing protein  35.06 
 
 		 121 aa  44.7  0.0004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.000000269051 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2896  hypothetical protein  30.86 
 
 		 125 aa  44.7  0.0004  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.328337 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  32.91 
 
 		 117 aa  44.3  0.0005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  29.63 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1195  hypothetical protein  32.61 
 
 		 372 aa  44.3  0.0006  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  28.57 
 
 		 123 aa  43.9  0.0008  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3000  hypothetical protein  28.44 
 
 		 123 aa  43.1  0.001  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0511761 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  29.91 
 
 		 186 aa  43.1  0.001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  27.37 
 
 		 486 aa  43.1  0.001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1499  hypothetical protein  28.92 
 
 		 124 aa  42.7  0.001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0060  hypothetical protein  28.92 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  33.82 
 
 		 97 aa  42.7  0.002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1566  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.92 
 
 		 124 aa  42.7  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0072  hypothetical protein  28.92 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0071  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.92 
 
 		 99 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0088  plastocyanin/azurin family copper binding protein  28.92 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1216  hypothetical protein  28.92 
 
 		 116 aa  42.7  0.002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2673  blue (type1) copper domain-containing protein  26.97 
 
 		 109 aa  42.7  0.002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0284633  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  29.81 
 
 		 160 aa  42.4  0.002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  30.86 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  31.08 
 
 		 72 aa  42.7  0.002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1129  hypothetical protein  30 
 
 		 454 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.32866 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1142  blue (type1) copper domain-containing protein  29.41 
 
 		 153 aa  41.6  0.004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.036139 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  23.29 
 
 		 146 aa  40.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  24.59 
 
 		 140 aa  40.4  0.007  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_1206  blue (type1) copper domain-containing protein  31.25 
 
 		 545 aa  40.4  0.008  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3095  blue (type1) copper domain-containing protein  26.47 
 
 		 192 aa  40  0.01  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>