101 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PMT9312_0581 on replicon NC_007577
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9312



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007577  PMT9312_0581  plastocyanin  100 
 
 		 116 aa  238  2e-62  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06071  plastocyanin  95.69 
 
 		 116 aa  230  5e-60  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_06371  plastocyanin  96.55 
 
 		 116 aa  230  6e-60  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06461  plastocyanin  92.24 
 
 		 116 aa  222  2e-57  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.937671  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10711  plastocyanin  79.13 
 
 		 128 aa  199  9.999999999999999e-51  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.590546 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0017  plastocyanin  76.72 
 
 		 116 aa  193  7e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.771707  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_06371  plastocyanin  76.72 
 
 		 116 aa  193  8.000000000000001e-49  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.0952102  normal  0.874773 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0916  plastocyanin  76.72 
 
 		 119 aa  192  2e-48  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.222865  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1015  plastocyanin  75.86 
 
 		 126 aa  190  6e-48  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.381594  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_18341  plastocyanin  73.91 
 
 		 119 aa  187  4e-47  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.259314 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1088  plastocyanin  63.72 
 
 		 125 aa  152  2e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000603452 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2240  plastocyanin  58.56 
 
 		 119 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2294  plastocyanin  58.56 
 
 		 119 aa  147  6e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0308558  normal  0.029451 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4559  plastocyanin  51.18 
 
 		 127 aa  129  1.0000000000000001e-29  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2745  plastocyanin  49.53 
 
 		 139 aa  109  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.412974 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0960  plastocyanin  43.52 
 
 		 139 aa  101  4e-21  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.821855  n/a   
 
 
-
 
NC_009363  OSTLU_34733  plastocyanin, chloroplast precursor  47.57 
 
 		 104 aa  100  8e-21  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0152  plastocyanin  43.8 
 
 		 143 aa  98.6  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00260566 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2563  plastocyanin  38.71 
 
 		 133 aa  83.6  9e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2688  halocyanin domain protein  37.23 
 
 		 179 aa  62  0.000000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.266175  normal  0.114793 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2615  blue (type 1) copper domain protein  35.96 
 
 		 109 aa  61.2  0.000000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.338185  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1621  blue (type 1) copper domain protein  35.51 
 
 		 110 aa  60.8  0.000000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0571414  normal  0.244235 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3100  halocyanin domain protein  35.48 
 
 		 224 aa  59.7  0.00000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2854  halocyanin domain protein  35.87 
 
 		 210 aa  58.9  0.00000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.811461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0599  plastocyanin/azurin family copper binding protein  38.89 
 
 		 111 aa  57.8  0.00000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0739  halocyanin domain protein  36.89 
 
 		 160 aa  57  0.00000007  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2435  halocyanin domain protein  32.74 
 
 		 347 aa  55.5  0.0000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  decreased coverage  0.000875368 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1244  blue (type1) copper domain-containing protein  31.18 
 
 		 173 aa  55.1  0.0000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4006  blue (type 1) copper domain protein  31.96 
 
 		 140 aa  55.1  0.0000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2424  blue (type1) copper domain-containing protein  36.36 
 
 		 150 aa  53.5  0.0000009  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1156  halocyanin domain protein  35.4 
 
 		 186 aa  53.1  0.000001  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.362387 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3202  blue (type 1) copper domain protein  34.34 
 
 		 807 aa  53.1  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.720894  normal  0.248673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2077  pseudoazurin  36.73 
 
 		 151 aa  52.4  0.000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.227415  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1313  blue (type 1) copper domain protein  35.96 
 
 		 172 aa  52.4  0.000002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.705795  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3272  blue (type1) copper domain-containing protein  36.84 
 
 		 116 aa  51.6  0.000004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.639699  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1871  blue (type 1) copper domain protein  34.31 
 
 		 221 aa  51.6  0.000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0614509 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2129  blue (type 1) copper domain protein  30.19 
 
 		 137 aa  51.2  0.000004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.550274 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4734  amicyanin  35.29 
 
 		 131 aa  51.2  0.000005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.164074  normal  0.171917 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4004  40-residue YVTN family beta-propeller repeat protein  38.81 
 
 		 417 aa  51.2  0.000005  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.540358  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1005  blue (type 1) copper domain protein  31.88 
 
 		 138 aa  51.2  0.000005  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5841  pseudoazurin  34.75 
 
 		 152 aa  49.7  0.00001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2726  pseudoazurin  32.1 
 
 		 147 aa  50.1  0.00001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2685  halocyanin domain protein  32.99 
 
 		 292 aa  50.1  0.00001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.197365  normal  0.0848247 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5624  pseudoazurin  33.04 
 
 		 152 aa  48.9  0.00002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.300096  normal  0.462695 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0561  amicyanin  33 
 
 		 119 aa  49.3  0.00002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0568  pseudoazurin  36.73 
 
 		 144 aa  48.9  0.00003  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.402992  normal  0.3405 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2780  blue (type 1) copper domain protein  40.62 
 
 		 112 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.235268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1443  blue (type1) copper domain-containing protein  35.87 
 
 		 152 aa  48.1  0.00004  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0793  halocyanin domain protein  31.96 
 
 		 205 aa  48.1  0.00004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.289912  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2687  putative pseudoazurin precursor  40.74 
 
 		 161 aa  47.8  0.00005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0140682  normal  1 
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4301  blue (type 1) copper domain protein  34.69 
 
 		 235 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_6275  pseudoazurin  35.8 
 
 		 147 aa  47.4  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.246646 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1139  blue (type 1) copper subtype  33.98 
 
 		 150 aa  47  0.00008  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.403504  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4824  blue (type1) copper domain-containing protein  30.83 
 
 		 160 aa  47  0.00008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.904248  normal  0.294152 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_5030  blue (type1) copper domain-containing protein  30.83 
 
 		 159 aa  47  0.00009  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.4583  normal  0.77741 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1926  pseudoazurin  33.7 
 
 		 144 aa  47  0.00009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.0642736 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0239  blue (type1) copper domain-containing protein  34.85 
 
 		 97 aa  46.2  0.0001  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1008  pseudoazurin  36.59 
 
 		 150 aa  46.2  0.0001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.338576  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1102  blue (type1) copper domain-containing protein  40.26 
 
 		 318 aa  46.6  0.0001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0581  halocyanin domain protein  33.33 
 
 		 212 aa  46.6  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0679046  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1788  plastocyanin-like protein  29.49 
 
 		 264 aa  45.8  0.0002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.341565  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4603  blue (type1) copper domain-containing protein  30.83 
 
 		 160 aa  45.8  0.0002  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.258245 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1226  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 358 aa  45.8  0.0002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0391  blue (type 1) copper domain protein  30 
 
 		 114 aa  45.8  0.0002  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.991228 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0570  halocyanin domain protein  33.33 
 
 		 209 aa  45.8  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.23024  n/a   
 
 
-
 
NC_007971  Rmet_6116  putative oxido-reductase protein CopI  31.15 
 
 		 158 aa  44.7  0.0004  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.251154  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0247  blue (type 1) copper domain protein  37.5 
 
 		 157 aa  44.7  0.0004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2055  pseudoazurin  33.33 
 
 		 144 aa  44.3  0.0006  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3194  blue (type1) copper domain-containing protein  34.29 
 
 		 104 aa  44.3  0.0006  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0575  blue (type 1) copper domain protein  29.51 
 
 		 141 aa  43.9  0.0007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.093408  normal  0.720315 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2978  putative copper binding protein  32.29 
 
 		 110 aa  43.9  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.359008  normal  1 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5106  blue (type 1) copper domain protein  27.59 
 
 		 160 aa  43.9  0.0008  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00549955 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4700  blue (type1) copper domain-containing protein  35.38 
 
 		 85 aa  43.1  0.001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1663  pseudoazurin  32.98 
 
 		 153 aa  43.1  0.001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0434336  normal  0.465433 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_1705  pseudoazurin  29.73 
 
 		 145 aa  43.5  0.001  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009717  Xaut_4902  blue (type1) copper domain-containing protein  29.17 
 
 		 156 aa  43.5  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0975  blue (type1) copper domain-containing protein  35.9 
 
 		 120 aa  43.1  0.001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1021  pseudoazurin  29.11 
 
 		 144 aa  43.1  0.001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1509  blue (type 1) copper domain protein  58.06 
 
 		 146 aa  43.5  0.001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0263  blue (type1) copper domain-containing protein  29.06 
 
 		 146 aa  42.7  0.002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.804107  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5049  blue (type1) copper domain-containing protein  32.86 
 
 		 104 aa  42.7  0.002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1260  blue (type1) copper domain-containing protein  31.09 
 
 		 272 aa  42.4  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0922125  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1678  blue (type1) copper domain-containing protein  32.95 
 
 		 336 aa  42.4  0.002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1087  pseudoazurin  27.85 
 
 		 148 aa  42.4  0.002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.155956 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6257  blue (type1) copper domain-containing protein  33.33 
 
 		 123 aa  42.7  0.002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.417235 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1216  pseudoazurin  27.85 
 
 		 146 aa  42.4  0.002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2540  blue-copper-protein-like protein  26.27 
 
 		 153 aa  41.6  0.003  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.00275414  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2655  blue (type1) copper domain-containing protein  33.04 
 
 		 164 aa  42  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.366193  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7490  Amicyanin precursor protein  28.26 
 
 		 104 aa  42  0.003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.41774  normal  0.342359 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4195  blue (type1) copper domain-containing protein  25.89 
 
 		 105 aa  42  0.003  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0422303  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0784  blue (type 1) copper domain protein  35.8 
 
 		 136 aa  42  0.003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.46005  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3670  blue (type1) copper domain-containing protein  31.76 
 
 		 112 aa  41.6  0.004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4690  plastocyanin like protein  32.1 
 
 		 72 aa  41.6  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.571062  normal  0.112783 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0258  pseudoazurin (cupredoxin) (blue copper protein)  30.95 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1173  halocyanin domain protein  31.96 
 
 		 136 aa  41.6  0.004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  hitchhiker  0.00281151 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5685  blue (type 1) copper domain protein  28.1 
 
 		 168 aa  41.6  0.004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0282  pseudoazurin  30.95 
 
 		 146 aa  40.8  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  33.72 
 
 		 168 aa  41.2  0.005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2134  blue (type1) copper domain-containing protein  32.47 
 
 		 117 aa  41.2  0.005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0741476  normal  0.352825 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1652  blue (type 1) copper domain protein  35.63 
 
 		 486 aa  40.8  0.006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  decreased coverage  0.00373533  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>