More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rcas_1574 on replicon NC_009767
Organism: Roseiflexus castenholzii DSM 13941



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 168 aa  344  3e-94  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  91.07 
 
 		 168 aa  323  6e-88  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  64.78 
 
 		 162 aa  231  3e-60  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  46.36 
 
 		 155 aa  156  2e-37  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  45.7 
 
 		 156 aa  152  2e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  45.03 
 
 		 156 aa  150  1e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  44.23 
 
 		 266 aa  149  1e-35  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  41.03 
 
 		 262 aa  137  4.999999999999999e-32  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  39.1 
 
 		 300 aa  127  8.000000000000001e-29  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  48.25 
 
 		 186 aa  121  4e-27  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  36.48 
 
 		 160 aa  114  5e-25  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  38.22 
 
 		 171 aa  114  5e-25  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  41.14 
 
 		 172 aa  113  1.0000000000000001e-24  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  37.58 
 
 		 160 aa  112  3e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  37.91 
 
 		 177 aa  106  2e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  37.91 
 
 		 195 aa  103  8e-22  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  34.42 
 
 		 185 aa  97.8  7e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  34.42 
 
 		 185 aa  97.1  9e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  34.42 
 
 		 190 aa  97.1  1e-19  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  34.19 
 
 		 190 aa  95.9  2e-19  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  34.72 
 
 		 190 aa  94  8e-19  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  36.5 
 
 		 165 aa  90.5  1e-17  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  32 
 
 		 190 aa  90.5  1e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  35.34 
 
 		 162 aa  84.7  5e-16  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  31.71 
 
 		 187 aa  81.6  0.000000000000005  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  40.79 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  40.79 
 
 		 350 aa  73.2  0.000000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 		 330 aa  72  0.000000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  41.98 
 
 		 256 aa  72  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  40.54 
 
 		 350 aa  71.6  0.000000000005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  39.47 
 
 		 351 aa  71.2  0.000000000006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.94 
 
 		 311 aa  67.8  0.00000000006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  30.51 
 
 		 271 aa  67.4  0.00000000009  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  30.22 
 
 		 243 aa  67  0.0000000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0186  cytochrome c oxidase subunit II  35.05 
 
 		 172 aa  67  0.0000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.721142  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  38.82 
 
 		 125 aa  65.5  0.0000000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  38.75 
 
 		 389 aa  65.5  0.0000000003  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  35.53 
 
 		 342 aa  65.1  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  38.16 
 
 		 316 aa  63.5  0.000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  36.9 
 
 		 272 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  34.03 
 
 		 149 aa  63.2  0.000000002  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  36.25 
 
 		 316 aa  63.2  0.000000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2971  cytochrome c oxidase, subunit II  31.62 
 
 		 176 aa  61.6  0.000000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  decreased coverage  0.00000000297195  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  38.27 
 
 		 352 aa  60.8  0.000000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  35.53 
 
 		 249 aa  60.8  0.000000009  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  36 
 
 		 367 aa  60.1  0.00000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6539  cytochrome c, monohaem  37.18 
 
 		 434 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.537411  normal  1 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  32.38 
 
 		 275 aa  59.7  0.00000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  27.33 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  38.36 
 
 		 337 aa  59.3  0.00000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  37.84 
 
 		 147 aa  60.1  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  27.33 
 
 		 337 aa  59.7  0.00000002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  33.73 
 
 		 124 aa  59.7  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1292  cytochrome c oxidase, subunit II  37.18 
 
 		 354 aa  59.7  0.00000002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.493898  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2167  cytochrome c oxidase, subunit II  35.9 
 
 		 316 aa  58.9  0.00000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.238577  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  31.71 
 
 		 384 aa  58.9  0.00000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6146  cytochrome c oxidase, subunit II  37.18 
 
 		 353 aa  59.3  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.870856  normal  0.304247 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  29.91 
 
 		 444 aa  58.5  0.00000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  34.94 
 
 		 355 aa  58.5  0.00000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  41.89 
 
 		 388 aa  58.5  0.00000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  33.33 
 
 		 351 aa  58.5  0.00000004  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  39.06 
 
 		 377 aa  58.2  0.00000005  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5502  cytochrome c oxidase, subunit II  35.9 
 
 		 370 aa  58.5  0.00000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.535121  normal  0.0572426 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1803  nitrous-oxide reductase  33.67 
 
 		 648 aa  58.5  0.00000005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.625051  normal  0.62653 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  36.84 
 
 		 360 aa  57.8  0.00000006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  32.43 
 
 		 314 aa  57.8  0.00000007  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  34.67 
 
 		 370 aa  57.8  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6572  cytochrome c, monohaem  35.9 
 
 		 352 aa  57.8  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.381109  normal  1 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  34.21 
 
 		 146 aa  57.4  0.00000009  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  35.9 
 
 		 274 aa  57.4  0.00000009  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  36.49 
 
 		 211 aa  57.4  0.00000009  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  25.76 
 
 		 285 aa  57.4  0.00000009  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2351  nitrous-oxide reductase  34.44 
 
 		 645 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6286  cytochrome c oxidase, subunit II  35.9 
 
 		 352 aa  57.4  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.257472  normal  0.0263748 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  34 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  34 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  34 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6008  nitrous-oxide reductase  35.44 
 
 		 639 aa  57.4  0.0000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.180938  normal  0.0225703 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  32 
 
 		 244 aa  57  0.0000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  34 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  34 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  34 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0783  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 		 372 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0156  cytochrome c oxidase, subunit II  36.11 
 
 		 232 aa  57  0.0000001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  40.62 
 
 		 378 aa  56.6  0.0000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  32.89 
 
 		 301 aa  57.4  0.0000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  34 
 
 		 141 aa  57  0.0000001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  31.63 
 
 		 125 aa  57  0.0000001  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  38.81 
 
 		 294 aa  56.6  0.0000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  38.24 
 
 		 284 aa  56.6  0.0000002  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0771  cytochrome c oxidase, subunit II  34.62 
 
 		 381 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0315373  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.33 
 
 		 355 aa  56.6  0.0000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0945  cytochrome oxidase subunit II  34.62 
 
 		 372 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.891376  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  30.25 
 
 		 374 aa  56.2  0.0000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 321 aa  56.6  0.0000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  28.57 
 
 		 663 aa  55.8  0.0000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  39.06 
 
 		 375 aa  55.5  0.0000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  35.8 
 
 		 313 aa  55.5  0.0000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.12 
 
 		 267 aa  55.8  0.0000003  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>