165 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bphy_1618 on replicon NC_010622
Organism: Burkholderia phymatum STM815



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010622  Bphy_1618  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 		 125 aa  254  4e-67  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.464579 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1408  cytochrome c oxidase family protein  70.08 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0216619  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2422  cytochrome c oxidase family protein  81.91 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1899  cytochrome c oxidase family protein  70.08 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3408  cytochrome c oxidase family protein  70.08 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.181168  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2257  putative cytochrome c oxidase subunit  81.91 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0923001  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2296  putative cytochrome c oxidase subunit  81.91 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.375881  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1172  cytochrome c oxidase family protein  70.08 
 
 		 141 aa  165  2e-40  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.0182872  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2175  cytochrome c oxidase family protein  79.79 
 
 		 141 aa  160  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.381678  n/a   
 
 
-
 
NC_003296  RS02212  putative cytochrome C oxidase polypeptide II oxidoreductase protein  61.7 
 
 		 125 aa  122  1e-27  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4253  cytochrome c oxidase, subunit II  55.67 
 
 		 124 aa  116  7.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0599  cytochrome c oxidase subunit II  53.26 
 
 		 124 aa  113  8.999999999999998e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.632482 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2412  cytochrome c oxidase subunit II  35.58 
 
 		 171 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2967  cytochrome c oxidase subunit II  35.71 
 
 		 162 aa  64.3  0.0000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000376263 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0761  cytochrome c oxidase subunit II  31.82 
 
 		 146 aa  61.6  0.000000003  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.254887  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  35.05 
 
 		 256 aa  61.6  0.000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.43 
 
 		 311 aa  61.6  0.000000003  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2385  cytochrome c oxidase subunit II  39.24 
 
 		 156 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1899  cytochrome c oxidase subunit II  37.97 
 
 		 156 aa  60.8  0.000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.71816  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3802  cytochrome c oxidase subunit II  33.65 
 
 		 262 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1574  cytochrome c oxidase subunit II  31.63 
 
 		 168 aa  57  0.00000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.226069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1950  cytochrome c oxidase, subunit II  34.52 
 
 		 158 aa  56.6  0.0000001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2021  cytochrome c oxidase subunit II  34.52 
 
 		 160 aa  55.8  0.0000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.388315  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0464  cytochrome c oxidase subunit II  27.91 
 
 		 266 aa  55.8  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_8116  cytochrome c oxidase subunit II  29.73 
 
 		 187 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.105438  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  32.94 
 
 		 302 aa  55.1  0.0000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0933  cytochrome c oxidase, subunit II  29.59 
 
 		 168 aa  55.1  0.0000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0884  cytochrome c oxidase, subunit II  29.91 
 
 		 120 aa  54.3  0.0000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.555731  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  34.21 
 
 		 272 aa  54.3  0.0000005  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5762  cytochrome c oxidase subunit II  31.19 
 
 		 195 aa  54.7  0.0000005  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.336691  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.78 
 
 		 316 aa  54.3  0.0000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013201  Hmuk_3373  cytochrome c oxidase subunit II  30.34 
 
 		 172 aa  53.9  0.0000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.208365  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  37.29 
 
 		 288 aa  52.4  0.000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3756  cytochrome c oxidase subunit II  30.19 
 
 		 300 aa  52.4  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0320  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 		 147 aa  51.6  0.000003  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 		 337 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  27.27 
 
 		 337 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2397  cytochrome c oxidase, subunit II  26.74 
 
 		 177 aa  50.8  0.000006  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  33.78 
 
 		 313 aa  50.8  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  32.88 
 
 		 315 aa  50.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_0440  nitrous-oxide reductase  36.71 
 
 		 864 aa  50.4  0.000009  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  0.136119  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  32.43 
 
 		 359 aa  50.4  0.000009  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  28.38 
 
 		 211 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  33.78 
 
 		 352 aa  50.1  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  26.53 
 
 		 337 aa  49.7  0.00001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 314 aa  50.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1944  cytochrome c oxidase, subunit II  29.59 
 
 		 149 aa  49.7  0.00001  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  34.48 
 
 		 301 aa  50.1  0.00001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2012  Nitrous-oxide reductase  30 
 
 		 663 aa  49.3  0.00002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  33.78 
 
 		 321 aa  49.3  0.00002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  32.84 
 
 		 389 aa  49.3  0.00002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  37.04 
 
 		 334 aa  49.3  0.00002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  30.14 
 
 		 330 aa  48.5  0.00003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1826  cytochrome c oxidase subunit II  26.32 
 
 		 160 aa  48.1  0.00003  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  hitchhiker  0.00813215  normal  0.126007 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  31.08 
 
 		 384 aa  48.5  0.00003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  30.56 
 
 		 271 aa  48.5  0.00003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  36.67 
 
 		 351 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1571  cytochrome c oxidase, subunit II  32.5 
 
 		 760 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.915615 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1575  cytochrome c oxidase, subunit II  32.5 
 
 		 760 aa  48.1  0.00004  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 329 aa  48.1  0.00004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  35.94 
 
 		 310 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  30.56 
 
 		 342 aa  47.8  0.00005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1491  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 		 190 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.403979  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2875  hypothetical protein  29.36 
 
 		 165 aa  47.8  0.00005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.902113  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0016  cytochrome c oxidase, subunit II  29.27 
 
 		 186 aa  47.8  0.00005  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1352  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1358  cytochrome c oxidase, subunit II  29.07 
 
 		 185 aa  47.8  0.00005  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1565  cytochrome c oxidase subunit II  30.49 
 
 		 155 aa  47.8  0.00005  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 362 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1298  nitrous-oxide reductase  32.91 
 
 		 865 aa  47.8  0.00006  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000502464  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1993  cytochrome c oxidase, subunit II  35.71 
 
 		 314 aa  47.4  0.00006  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0975891  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 362 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0244  nitrous-oxide reductase  28.85 
 
 		 647 aa  47.8  0.00006  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.677359  normal  1 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1729  methyl-accepting chemotaxis protein  32.91 
 
 		 862 aa  47.4  0.00006  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.371209  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 		 362 aa  47.4  0.00006  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  32.88 
 
 		 339 aa  47.4  0.00007  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0209  Nitrous-oxide reductase  28.4 
 
 		 632 aa  47.4  0.00007  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0010  4Fe-4S ferredoxin, iron-sulfur binding  32.91 
 
 		 863 aa  47.4  0.00007  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.0271061  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  28.38 
 
 		 269 aa  47  0.00008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0348  cytochrome c oxidase subunit II  27.37 
 
 		 190 aa  47  0.00009  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1770  nitrous-oxide reductase NosZ  34.18 
 
 		 864 aa  46.2  0.0001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  28.75 
 
 		 382 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  28.77 
 
 		 351 aa  46.6  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  28.75 
 
 		 382 aa  46.6  0.0001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2313  cytochrome c oxidase, subunit II  33.73 
 
 		 244 aa  45.8  0.0002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.210732  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.85 
 
 		 324 aa  45.4  0.0002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4077  putative cytochrome c oxidase subunit II  27.37 
 
 		 190 aa  45.8  0.0002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.357197 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0623  cytochrome c oxidase subunit II  27.37 
 
 		 190 aa  45.4  0.0002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.320942 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  30.14 
 
 		 272 aa  45.8  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  30.14 
 
 		 272 aa  46.2  0.0002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  30.14 
 
 		 314 aa  46.2  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  36.36 
 
 		 304 aa  45.8  0.0002  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  31.51 
 
 		 444 aa  45.4  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1402  cytochrome c oxidase, subunit II  29.57 
 
 		 162 aa  45.4  0.0003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.290296  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  25.53 
 
 		 408 aa  45.1  0.0003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  28.38 
 
 		 318 aa  45.4  0.0003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  30.14 
 
 		 391 aa  45.1  0.0003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0697  cytochrome c oxidase, subunit II  32.74 
 
 		 322 aa  45.1  0.0003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  30.14 
 
 		 382 aa  44.7  0.0004  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  24.56 
 
 		 249 aa  44.7  0.0004  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>