More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noc_1244 on replicon NC_007484
Organism: Nitrosococcus oceani ATCC 19707



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
211 aa  437  9.999999999999999e-123  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  49.52 
 
 
329 aa  223  2e-57  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  49.52 
 
 
330 aa  222  3e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  48.51 
 
 
362 aa  209  3e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  47.62 
 
 
316 aa  206  2e-52  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  49.01 
 
 
313 aa  204  1e-51  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  47.52 
 
 
314 aa  202  2e-51  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  46.7 
 
 
329 aa  201  6e-51  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  48.02 
 
 
362 aa  201  7e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  48.28 
 
 
342 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  45.27 
 
 
318 aa  198  6e-50  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  47.52 
 
 
362 aa  198  6e-50  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  47.52 
 
 
310 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  46.04 
 
 
359 aa  193  1e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  43 
 
 
321 aa  176  2e-43  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  40.7 
 
 
316 aa  160  1e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  39.7 
 
 
350 aa  159  4e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  40.2 
 
 
350 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  40.2 
 
 
350 aa  158  5e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  35.29 
 
 
311 aa  154  9e-37  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  38.42 
 
 
351 aa  151  5.9999999999999996e-36  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 
330 aa  151  8.999999999999999e-36  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  37.14 
 
 
337 aa  146  3e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  37.14 
 
 
337 aa  145  3e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  35.02 
 
 
389 aa  145  4.0000000000000006e-34  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  36.19 
 
 
337 aa  144  9e-34  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  35.68 
 
 
399 aa  144  1e-33  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  36.22 
 
 
318 aa  139  1.9999999999999998e-32  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  37.44 
 
 
408 aa  140  1.9999999999999998e-32  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  35.03 
 
 
301 aa  139  3e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  34.68 
 
 
358 aa  134  9e-31  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  35.38 
 
 
426 aa  134  9.999999999999999e-31  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  37.77 
 
 
288 aa  133  1.9999999999999998e-30  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  34.17 
 
 
302 aa  131  6.999999999999999e-30  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  34.67 
 
 
300 aa  129  4.0000000000000003e-29  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  27.06 
 
 
339 aa  121  7e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  28.45 
 
 
315 aa  120  1.9999999999999998e-26  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 
405 aa  119  3e-26  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  31.86 
 
 
271 aa  118  4.9999999999999996e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  34.11 
 
 
352 aa  118  6e-26  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.06 
 
 
274 aa  117  9e-26  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  30.09 
 
 
316 aa  117  9.999999999999999e-26  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  29.65 
 
 
390 aa  117  1.9999999999999998e-25  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  31.3 
 
 
389 aa  115  6e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.33 
 
 
270 aa  114  1.0000000000000001e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  40 
 
 
336 aa  114  1.0000000000000001e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.02 
 
 
291 aa  113  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30 
 
 
267 aa  114  2.0000000000000002e-24  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  29.69 
 
 
276 aa  114  2.0000000000000002e-24  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  31.34 
 
 
400 aa  113  2.0000000000000002e-24  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  28.45 
 
 
270 aa  112  3e-24  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  38.39 
 
 
351 aa  113  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.69 
 
 
267 aa  112  4.0000000000000004e-24  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  33.33 
 
 
359 aa  112  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 
389 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 
389 aa  112  4.0000000000000004e-24  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.02 
 
 
324 aa  111  6e-24  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  26.7 
 
 
311 aa  111  6e-24  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  30.21 
 
 
523 aa  111  9e-24  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 
402 aa  110  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  27.16 
 
 
538 aa  110  1.0000000000000001e-23  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  29.63 
 
 
398 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  30.13 
 
 
267 aa  110  2.0000000000000002e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  27.95 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0276  cytochrome c oxidase, subunit II  28.14 
 
 
557 aa  110  2.0000000000000002e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  26.64 
 
 
388 aa  109  2.0000000000000002e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  28.95 
 
 
298 aa  109  3e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  31.08 
 
 
380 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  28.27 
 
 
532 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  28.27 
 
 
532 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 
517 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 
525 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 
525 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 
517 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  28.27 
 
 
531 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  27.59 
 
 
544 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  28.14 
 
 
525 aa  109  4.0000000000000004e-23  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 
525 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 
525 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 
517 aa  108  4.0000000000000004e-23  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.76 
 
 
304 aa  108  5e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 
532 aa  108  5e-23  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0255  cytochrome-c oxidase  31.16 
 
 
285 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3463  cytochrome-c oxidase  31.16 
 
 
285 aa  108  5e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2233  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 
532 aa  108  5e-23  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.247804  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  28.89 
 
 
302 aa  107  1e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  30.08 
 
 
311 aa  107  1e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2902  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 
535 aa  107  1e-22  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  28.88 
 
 
273 aa  107  2e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  29.84 
 
 
347 aa  107  2e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2764  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 
535 aa  107  2e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.802533  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  29.26 
 
 
275 aa  106  3e-22  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  26.38 
 
 
385 aa  106  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  25.41 
 
 
321 aa  105  4e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 
418 aa  105  4e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 
418 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  28.45 
 
 
382 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  28.45 
 
 
382 aa  105  5e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  29.28 
 
 
521 aa  105  6e-22  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  27.27 
 
 
391 aa  105  6e-22  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>