More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Rleg_5948 on replicon NC_012853
Organism: Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 
318 aa  657    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  47.42 
 
 
316 aa  313  2.9999999999999996e-84  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  47.57 
 
 
314 aa  306  4.0000000000000004e-82  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  50 
 
 
313 aa  294  1e-78  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  44.27 
 
 
329 aa  293  2e-78  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.0922258 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  45.48 
 
 
342 aa  287  2e-76  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  43.52 
 
 
330 aa  285  1.0000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  44.59 
 
 
329 aa  284  1.0000000000000001e-75  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  48.67 
 
 
310 aa  282  4.0000000000000003e-75  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  45.42 
 
 
362 aa  279  4e-74  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  44.66 
 
 
359 aa  276  5e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  44.7 
 
 
362 aa  273  2.0000000000000002e-72  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  44.7 
 
 
362 aa  268  1e-70  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  40.52 
 
 
321 aa  259  3e-68  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  38.1 
 
 
330 aa  218  1e-55  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  41.43 
 
 
316 aa  218  2e-55  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  39.06 
 
 
337 aa  216  5.9999999999999996e-55  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  38.87 
 
 
337 aa  214  1.9999999999999998e-54  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  38.87 
 
 
337 aa  213  2.9999999999999995e-54  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  35.59 
 
 
358 aa  198  7.999999999999999e-50  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  32.74 
 
 
389 aa  192  6e-48  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  35.22 
 
 
350 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  35.22 
 
 
350 aa  192  7e-48  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  34.73 
 
 
350 aa  191  1e-47  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  32.72 
 
 
351 aa  190  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  33.79 
 
 
311 aa  189  4e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  45.27 
 
 
211 aa  188  1e-46  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  35.1 
 
 
408 aa  187  3e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  31.1 
 
 
302 aa  178  9e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  33.22 
 
 
288 aa  177  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  34.31 
 
 
405 aa  176  5e-43  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  30.33 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  30.33 
 
 
382 aa  174  1.9999999999999998e-42  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  32.14 
 
 
388 aa  172  5e-42  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  33.99 
 
 
399 aa  171  2e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  32.57 
 
 
300 aa  170  3e-41  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  32.12 
 
 
301 aa  166  4e-40  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  32.67 
 
 
318 aa  166  5e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  32.31 
 
 
426 aa  166  5.9999999999999996e-40  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  30.9 
 
 
382 aa  166  5.9999999999999996e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  30.61 
 
 
382 aa  164  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  28.31 
 
 
391 aa  164  2.0000000000000002e-39  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  29.19 
 
 
384 aa  161  1e-38  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  27.35 
 
 
444 aa  161  1e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  29.74 
 
 
394 aa  160  3e-38  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  31.16 
 
 
384 aa  158  1e-37  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  29.77 
 
 
351 aa  121  9.999999999999999e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  36.65 
 
 
243 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  34.12 
 
 
338 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  29.61 
 
 
272 aa  118  9.999999999999999e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  29.29 
 
 
344 aa  118  1.9999999999999998e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.91 
 
 
324 aa  116  3.9999999999999997e-25  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  30.65 
 
 
314 aa  116  5e-25  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.86 
 
 
267 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  34.86 
 
 
267 aa  116  5e-25  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  30.41 
 
 
269 aa  115  6.9999999999999995e-25  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  29.09 
 
 
272 aa  115  6.9999999999999995e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  35.43 
 
 
267 aa  115  7.999999999999999e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  32.11 
 
 
334 aa  114  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  33.75 
 
 
330 aa  114  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4760  cytochrome c oxidase subunit II  35.4 
 
 
327 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.723293  normal  0.0836993 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  27.83 
 
 
367 aa  114  2.0000000000000002e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  28.95 
 
 
271 aa  114  2.0000000000000002e-24  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  31.22 
 
 
273 aa  114  2.0000000000000002e-24  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  28.97 
 
 
311 aa  110  2.0000000000000002e-23  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2347  cytochrome c oxidase, subunit II  31.76 
 
 
334 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  30.81 
 
 
308 aa  110  2.0000000000000002e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  26.21 
 
 
388 aa  110  3e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  26.28 
 
 
370 aa  110  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1874  cytochrome c oxidase, subunit II  32.09 
 
 
256 aa  110  3e-23  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  30.2 
 
 
326 aa  110  3e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0104  cytochrome c oxidase subunit II  27.04 
 
 
359 aa  110  4.0000000000000004e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.100023  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  28.9 
 
 
315 aa  109  5e-23  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  44.04 
 
 
267 aa  109  6e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5491  cytochrome c oxidase, subunit II  31.46 
 
 
355 aa  109  6e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.31459  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1767  cytochrome c oxidase, subunit II  30.36 
 
 
352 aa  108  8.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.204958  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  42.99 
 
 
351 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  29.88 
 
 
320 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  29.22 
 
 
285 aa  108  1e-22  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  33.47 
 
 
311 aa  108  1e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  29.88 
 
 
320 aa  108  1e-22  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4792  cytochrome c oxidase, subunit II  35.57 
 
 
354 aa  108  1e-22  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0280165  normal  0.517537 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.75 
 
 
291 aa  108  1e-22  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  29.31 
 
 
280 aa  108  1e-22  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  41.8 
 
 
316 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  43.36 
 
 
336 aa  108  2e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  29.6 
 
 
276 aa  107  2e-22  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  28.16 
 
 
346 aa  107  2e-22  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  31.64 
 
 
321 aa  107  3e-22  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  28.72 
 
 
378 aa  107  3e-22  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  26.75 
 
 
355 aa  107  3e-22  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0167  putative cytochrome c oxidase subunit II  32.26 
 
 
371 aa  105  9e-22  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.26265  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  45.05 
 
 
270 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  45.05 
 
 
270 aa  105  1e-21  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  39.29 
 
 
304 aa  105  1e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  30.32 
 
 
272 aa  105  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  30.19 
 
 
279 aa  105  1e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  24.2 
 
 
422 aa  105  1e-21  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6354  cytochrome c oxidase subunit II  31.91 
 
 
334 aa  104  2e-21  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  42.45 
 
 
355 aa  103  3e-21  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>