More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Meso_2474 on replicon NC_008254
Organism: Chelativorans sp. BNC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 273 aa  562  1.0000000000000001e-159  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  72 
 
 		 314 aa  404  1.0000000000000001e-112  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  70 
 
 		 272 aa  394  1e-109  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2358  cytochrome c oxidase subunit II  64.75 
 
 		 280 aa  396  1e-109  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.382023  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  67.7 
 
 		 285 aa  391  1e-108  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  69.2 
 
 		 272 aa  389  1e-107  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  57.92 
 
 		 391 aa  331  1e-89  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0726  cytochrome c oxidase, subunit II  55.98 
 
 		 388 aa  330  2e-89  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.631169  normal  1 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  55.77 
 
 		 382 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  55.77 
 
 		 382 aa  326  2.0000000000000001e-88  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  60 
 
 		 444 aa  326  3e-88  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  55.77 
 
 		 382 aa  323  2e-87  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  55.77 
 
 		 382 aa  322  4e-87  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  59.02 
 
 		 384 aa  321  7e-87  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5130  cytochrome c oxidase subunit II  56.15 
 
 		 384 aa  320  1.9999999999999998e-86  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  55.56 
 
 		 394 aa  314  9.999999999999999e-85  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  52.08 
 
 		 269 aa  301  8.000000000000001e-81  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2345  cytochrome c oxidase subunit II  46.56 
 
 		 271 aa  255  6e-67  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.215159  normal  0.967701 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1640  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.44 
 
 		 396 aa  160  2e-38  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  hitchhiker  0.0000507027  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0523  cytochrome c oxidase subunit II  36.6 
 
 		 353 aa  159  4e-38  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  decreased coverage  0.00550922  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01285  Cytochrome c oxidase, subunit II:Cytochrome c, class I  31.33 
 
 		 359 aa  155  9e-37  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5670  cytochrome c oxidase subunit II  37.93 
 
 		 373 aa  152  4e-36  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3471  cytochrome c oxidase subunit II  34.19 
 
 		 370 aa  151  8.999999999999999e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0997711  normal  0.165063 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2207  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidase, subunit 2  34.28 
 
 		 347 aa  149  4e-35  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  hitchhiker  0.0000000350149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0294  cytochrome c oxidase subunit II  35.51 
 
 		 408 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  decreased coverage  0.00251297  hitchhiker  0.000594912 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0437  cytochrome c oxidase, subunit II  32.2 
 
 		 267 aa  139  3.9999999999999997e-32  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  0.0468935 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  30.67 
 
 		 399 aa  122  7e-27  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  29.79 
 
 		 370 aa  120  3e-26  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  34.12 
 
 		 269 aa  119  3.9999999999999996e-26  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  34.4 
 
 		 342 aa  119  4.9999999999999996e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  36.18 
 
 		 313 aa  117  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  31 
 
 		 408 aa  117  3e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.76 
 
 		 367 aa  117  3e-25  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  36.87 
 
 		 389 aa  114  1.0000000000000001e-24  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  31.22 
 
 		 318 aa  114  1.0000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  32.3 
 
 		 344 aa  114  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  31.49 
 
 		 321 aa  113  3e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  33.61 
 
 		 362 aa  112  7.000000000000001e-24  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  30.27 
 
 		 337 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  35.02 
 
 		 380 aa  111  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2862  cytochrome c oxidase subunit II  32.89 
 
 		 272 aa  111  1.0000000000000001e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0315403 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  29.45 
 
 		 339 aa  111  1.0000000000000001e-23  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  33.47 
 
 		 362 aa  110  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  30.99 
 
 		 330 aa  110  2.0000000000000002e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  29.89 
 
 		 337 aa  110  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  39.61 
 
 		 362 aa  109  5e-23  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  31.91 
 
 		 310 aa  108  7.000000000000001e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  29.72 
 
 		 291 aa  108  8.000000000000001e-23  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  29.44 
 
 		 426 aa  108  8.000000000000001e-23  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  32.85 
 
 		 330 aa  108  8.000000000000001e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.8 
 
 		 359 aa  108  9.000000000000001e-23  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  29.5 
 
 		 337 aa  108  9.000000000000001e-23  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  31.48 
 
 		 314 aa  108  1e-22  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  31.61 
 
 		 311 aa  107  2e-22  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  28.97 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  31.2 
 
 		 302 aa  107  3e-22  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  48.98 
 
 		 315 aa  107  3e-22  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  28.97 
 
 		 279 aa  106  3e-22  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0669  cytochrome c oxidase subunit II  28.38 
 
 		 279 aa  106  4e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.12333  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  32.02 
 
 		 525 aa  105  6e-22  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  30.2 
 
 		 288 aa  105  1e-21  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  32.11 
 
 		 405 aa  105  1e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  46.94 
 
 		 351 aa  104  1e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  28.5 
 
 		 279 aa  105  1e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  31.9 
 
 		 288 aa  103  2e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0507  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 525 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2849  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 517 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3197  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 525 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0170  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 517 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.32275  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  27.64 
 
 		 279 aa  104  2e-21  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0672  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 525 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1422  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 517 aa  104  2e-21  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0848  cytochrome c oxidase subunit II  28.64 
 
 		 351 aa  103  2e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.58 
 
 		 525 aa  104  2e-21  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  31.98 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  29.83 
 
 		 329 aa  104  2e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  34.02 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0851  cytochrome c oxidase, subunit II  28.77 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0855  cytochrome c oxidase, subunit II  28.77 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  31.12 
 
 		 285 aa  103  3e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0803  cytochrome c oxidase, subunit II  28.77 
 
 		 350 aa  103  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.192306  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  33.76 
 
 		 211 aa  103  4e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  32.88 
 
 		 402 aa  102  6e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 		 318 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 		 405 aa  102  8e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  47.19 
 
 		 267 aa  102  1e-20  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 		 531 aa  101  1e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  47.19 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2706  cytochrome c oxidase, subunit II  32.58 
 
 		 389 aa  101  1e-20  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.363999 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 		 532 aa  101  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  31.34 
 
 		 398 aa  102  1e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  47.19 
 
 		 267 aa  101  1e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2858  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 		 532 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.760436 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  48.35 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  28.38 
 
 		 300 aa  100  2e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  28.69 
 
 		 276 aa  101  2e-20  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  31.14 
 
 		 532 aa  100  2e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  34.36 
 
 		 377 aa  101  2e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  48.35 
 
 		 270 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  47.19 
 
 		 267 aa  100  2e-20  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>