More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Syncc9605_0981 on replicon NC_007516
Organism: Synechococcus sp. CC9605



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007516  Syncc9605_0981  cytochrome c oxidase subunit II  100 
 
 
311 aa  633  1e-180  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.0740961  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_12631  cytochrome c oxidase subunit II  58.22 
 
 
311 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0179  cytochrome c oxidase, subunit II  46.23 
 
 
298 aa  263  4e-69  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4298  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  42.95 
 
 
304 aa  250  2e-65  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.00204319  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0278  cytochrome c oxidase, subunit II  45.59 
 
 
302 aa  244  9.999999999999999e-64  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.498963  normal  0.0449669 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3660  cytochrome c oxidase subunit II  43.26 
 
 
308 aa  240  2e-62  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3139  cytochrome c oxidase subunit II  43.46 
 
 
316 aa  240  2.9999999999999997e-62  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3577  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  38.28 
 
 
311 aa  210  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0252366 
 
 
-
 
NC_014249  Aazo_5318  cytochrome c oxidase subunit II  37.04 
 
 
299 aa  200  1.9999999999999998e-50  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0608  cytochrome c oxidase subunit II  33.46 
 
 
276 aa  157  2e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04431  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.95 
 
 
291 aa  151  2e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1777  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.06 
 
 
270 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1754  cytochrome c oxidase subunit II  32.68 
 
 
275 aa  148  1.0000000000000001e-34  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.636353  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_05001  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  31.06 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.715952  normal  0.110072 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  32.17 
 
 
320 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  32.17 
 
 
320 aa  143  4e-33  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_06421  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.33 
 
 
274 aa  142  5e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0878998 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0445  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.58 
 
 
267 aa  136  4e-31  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0528  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  29.14 
 
 
355 aa  134  9.999999999999999e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 
328 aa  134  1.9999999999999998e-30  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05011  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.46 
 
 
267 aa  132  5e-30  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04701  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  33.08 
 
 
267 aa  132  6.999999999999999e-30  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0446  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  30.08 
 
 
324 aa  130  3e-29  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.112901 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3958  cytochrome c oxidase, subunit II  29.35 
 
 
336 aa  127  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2641  cytochrome c oxidase subunit II  31.15 
 
 
321 aa  126  4.0000000000000003e-28  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.398022  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  26.41 
 
 
339 aa  125  1e-27  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  28.98 
 
 
315 aa  124  2e-27  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4435  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  34.67 
 
 
316 aa  120  1.9999999999999998e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0428074  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0229  cytochrome c oxidase, subunit II  31.15 
 
 
316 aa  120  3e-26  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0502681  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0414  cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  32.88 
 
 
311 aa  118  9.999999999999999e-26  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1522  cytochrome c oxidase, subunit II  33.61 
 
 
330 aa  117  1.9999999999999998e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05081  putative cytochrome c oxidase, subunit 2  32.7 
 
 
267 aa  118  1.9999999999999998e-25  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.189517  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2275  cytochrome c oxidase, subunit II  34.89 
 
 
337 aa  117  3e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.869151  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1538  cytochrome c oxidase, subunit II  34.68 
 
 
399 aa  117  3e-25  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1600  cytochrome c oxidase, subunit II  32.81 
 
 
337 aa  116  5e-25  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.884566  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1676  cytochrome c oxidase, subunit II  32.81 
 
 
337 aa  115  6.9999999999999995e-25  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2419  cytochrome c oxidase, subunit II  29.59 
 
 
358 aa  114  2.0000000000000002e-24  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0372558  normal  0.514395 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1903  cytochrome c oxidase, subunit II  30.53 
 
 
344 aa  112  7.000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1826  cytochrome c oxidase, subunit II, putative  31.56 
 
 
408 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.086817  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5948  cytochrome c oxidase, subunit II  33.47 
 
 
318 aa  109  7.000000000000001e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2529  caa3-type cytochrome c oxidase, subunit II  32.62 
 
 
318 aa  103  3e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.176117  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0252  cytochrome c oxidase, subunit II  29.92 
 
 
302 aa  103  3e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.433496  normal  0.0258846 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0533  cytochrome c oxidase, subunit II  32.27 
 
 
405 aa  103  4e-21  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.251737 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_3989  cytochrome c oxidase, subunit II  28.84 
 
 
330 aa  102  6e-21  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2996  cytochrome c oxidase, subunit II  30.45 
 
 
329 aa  102  7e-21  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.941612  hitchhiker  0.00487692 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1588  cytochrome c oxidase, subunit II  32.57 
 
 
342 aa  100  2e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1211  Cytochrome-c oxidase  43.4 
 
 
351 aa  99.4  6e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.553445  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3573  cytochrome c oxidase subunit II  40.19 
 
 
360 aa  97.4  2e-19  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  29.77 
 
 
314 aa  97.8  2e-19  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.548982  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  28.66 
 
 
289 aa  98.2  2e-19  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0046  cytochrome c oxidase, subunit II  28.5 
 
 
301 aa  96.7  4e-19  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6886  cytochrome c oxidase, subunit II  32.74 
 
 
313 aa  96.7  4e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1348  cytochrome c, monohaem  31.25 
 
 
426 aa  96.3  5e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.195405  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3540  cytochrome c oxidase, subunit II  29.69 
 
 
311 aa  95.5  9e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  32.29 
 
 
243 aa  95.5  1e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  32.73 
 
 
321 aa  95.1  1e-18  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.304556 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2958  cytochrome c oxidase subunit II  29.44 
 
 
269 aa  95.1  1e-18  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1244  cytochrome c oxidase, subunit II  28.32 
 
 
211 aa  94.4  2e-18  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  27.36 
 
 
299 aa  93.6  4e-18  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0222  cytochrome c oxidase, subunit II  29.84 
 
 
362 aa  92.8  6e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0145699  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  29.33 
 
 
312 aa  92.4  9e-18  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  30.36 
 
 
324 aa  92  1e-17  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 
287 aa  91.7  1e-17  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5817  cytochrome c oxidase, subunit II  42.86 
 
 
310 aa  91.7  1e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.156146  hitchhiker  0.00847969 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0254  cytochrome c oxidase subunit II  33.12 
 
 
269 aa  91.3  2e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00721127 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0045  cytochrome c oxidase, subunit II  26.81 
 
 
300 aa  91.3  2e-17  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00101143 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  26.51 
 
 
304 aa  88.6  1e-16  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  28.98 
 
 
370 aa  89  1e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0024  cytochrome c oxidase, subunit II  37.5 
 
 
362 aa  88.6  1e-16  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.901821 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0166  cytochrome c oxidase, subunit II  30.92 
 
 
362 aa  88.2  1e-16  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.129501  normal  0.0168942 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  25.98 
 
 
385 aa  89  1e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  26.91 
 
 
255 aa  87.8  2e-16  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2474  cytochrome c oxidase, subunit II  32.87 
 
 
273 aa  87.8  2e-16  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.850241  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.21 
 
 
367 aa  87  4e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6229  cytochrome c oxidase, subunit II  30.45 
 
 
359 aa  86.7  5e-16  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.24435  normal  0.0456922 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6209  cytochrome c oxidase, subunit II  31.72 
 
 
382 aa  86.3  6e-16  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0222  cytochrome c oxidase, subunit II  28.5 
 
 
288 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5936  cytochrome c oxidase subunit II  31.72 
 
 
382 aa  85.5  0.000000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4872  cytochrome c oxidase subunit II  30.61 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.780427  normal  0.052805 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5826  cytochrome c oxidase, subunit II  37.1 
 
 
330 aa  85.1  0.000000000000001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_3795  cytochrome c oxidase subunit II  30.61 
 
 
382 aa  85.1  0.000000000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_3955  cytochrome c oxidase subunit II  29.17 
 
 
391 aa  85.5  0.000000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.113374 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  29.36 
 
 
269 aa  85.1  0.000000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  29.57 
 
 
324 aa  84.7  0.000000000000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  33.82 
 
 
314 aa  84.7  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2991  cytochrome c oxidase, subunit II  36.5 
 
 
338 aa  84.3  0.000000000000002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.336386  normal  0.0255364 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0628  cytochrome c oxidase, subunit II  29.18 
 
 
351 aa  84.7  0.000000000000002  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.197881 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2268  cytochrome c oxidase subunit II  32.17 
 
 
272 aa  84.7  0.000000000000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.130236  normal 
 
 
-
 
NC_003296  RSp1564  cytochrome C oxidase polypeptide II  30.22 
 
 
384 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B3632  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I  30.56 
 
 
444 aa  83.6  0.000000000000004  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  26.75 
 
 
304 aa  83.6  0.000000000000004  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  27.21 
 
 
290 aa  82.8  0.000000000000006  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2594  cytochrome c oxidase subunit II  31.25 
 
 
272 aa  83.2  0.000000000000006  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0132206  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  26.59 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  26.59 
 
 
279 aa  82.8  0.000000000000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7362  cytochrome c oxidase, subunit II  30.77 
 
 
394 aa  82.8  0.000000000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.674364 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3898  cytochrome c oxidase subunit II  31.29 
 
 
285 aa  82  0.00000000000001  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1705  cytochrome c, monohaem  34.33 
 
 
324 aa  81.6  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.829367  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  28.83 
 
 
290 aa  82  0.00000000000001  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  26.44 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>