More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_3141 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 324 aa  667    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  47.04 
 
 		 287 aa  243  3e-63  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  41.9 
 
 		 324 aa  234  2.0000000000000002e-60  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  44.44 
 
 		 304 aa  233  4.0000000000000004e-60  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  42.04 
 
 		 299 aa  233  4.0000000000000004e-60  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  41.25 
 
 		 299 aa  231  9e-60  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  42.41 
 
 		 290 aa  220  1.9999999999999999e-56  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  41.99 
 
 		 304 aa  218  7.999999999999999e-56  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  44.61 
 
 		 340 aa  218  8.999999999999998e-56  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  42.46 
 
 		 289 aa  218  1e-55  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  43.28 
 
 		 260 aa  217  2e-55  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  43.17 
 
 		 280 aa  214  1.9999999999999998e-54  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  43.89 
 
 		 290 aa  213  2.9999999999999995e-54  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  40.29 
 
 		 314 aa  207  1e-52  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  39.22 
 
 		 269 aa  203  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  40.83 
 
 		 288 aa  201  9.999999999999999e-51  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  41.11 
 
 		 275 aa  200  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  41.09 
 
 		 288 aa  196  4.0000000000000005e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  45.31 
 
 		 265 aa  196  6e-49  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  39.37 
 
 		 316 aa  191  1e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  38.87 
 
 		 312 aa  185  7e-46  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  38.43 
 
 		 286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  41.5 
 
 		 323 aa  181  1e-44  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  40.71 
 
 		 323 aa  181  2e-44  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  36.59 
 
 		 316 aa  175  9e-43  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  37.32 
 
 		 311 aa  169  7e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  39 
 
 		 257 aa  166  4e-40  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  40.25 
 
 		 289 aa  162  7e-39  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  32.15 
 
 		 398 aa  161  2e-38  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  33.64 
 
 		 363 aa  161  2e-38  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  30.77 
 
 		 366 aa  152  8e-36  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 352 aa  150  3e-35  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  31.86 
 
 		 344 aa  144  2e-33  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  36.96 
 
 		 315 aa  143  5e-33  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  32.66 
 
 		 344 aa  143  5e-33  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3459  cytochrome c oxidase, subunit II  29.37 
 
 		 279 aa  116  5e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.927042  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  33.57 
 
 		 311 aa  116  6e-25  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3263  cytochrome c oxidase, subunit II  29.37 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.571759  normal  0.256995 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3587  cytochrome c oxidase, subunit II  29.37 
 
 		 279 aa  115  7.999999999999999e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.677515  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  33.48 
 
 		 389 aa  115  7.999999999999999e-25  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0033  cytochrome c oxidase, subunit II  27.24 
 
 		 279 aa  115  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.979273  normal  0.511366 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  30.4 
 
 		 343 aa  114  2.0000000000000002e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  33.33 
 
 		 390 aa  114  3e-24  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  32.31 
 
 		 370 aa  113  5e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2489  cytochrome c oxidase, subunit II  33.02 
 
 		 243 aa  113  5e-24  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.500427  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  30.64 
 
 		 367 aa  112  7.000000000000001e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  29.13 
 
 		 402 aa  111  1.0000000000000001e-23  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0518  cytochrome c oxidase subunit II  30.84 
 
 		 294 aa  110  2.0000000000000002e-23  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2797  cytochrome c oxidase, subunit II  32.2 
 
 		 249 aa  110  4.0000000000000004e-23  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2860  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 		 389 aa  109  6e-23  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.699909  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  29.18 
 
 		 254 aa  109  6e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  32.66 
 
 		 304 aa  109  6e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  32.26 
 
 		 398 aa  108  8.000000000000001e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3537  cytochrome c oxidase, subunit II  31.94 
 
 		 389 aa  108  1e-22  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.0700115  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0581  cytochrome c oxidase subunit II  32.23 
 
 		 294 aa  108  1e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  hitchhiker  0.00300077  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0467  cytochrome c oxidase, subunit II  33.16 
 
 		 284 aa  107  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.870117  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  28.8 
 
 		 523 aa  107  2e-22  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0814  cytochrome-c oxidase  27.76 
 
 		 284 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.278116  normal  1 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  31.35 
 
 		 385 aa  107  3e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  31.93 
 
 		 388 aa  107  4e-22  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  30.87 
 
 		 380 aa  106  4e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  34.27 
 
 		 400 aa  107  4e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  30.74 
 
 		 544 aa  106  5e-22  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  31.73 
 
 		 255 aa  106  6e-22  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1779  cytochrome c oxidase, subunit II  29.39 
 
 		 339 aa  106  6e-22  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  31.13 
 
 		 385 aa  105  8e-22  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2234  cytochrome-c oxidase  28.88 
 
 		 292 aa  105  8e-22  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00748725 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  30.4 
 
 		 375 aa  105  9e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  28.99 
 
 		 421 aa  105  1e-21  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  29.72 
 
 		 320 aa  105  1e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0614  cytochrome-c oxidase  34.42 
 
 		 303 aa  105  1e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  32.31 
 
 		 392 aa  104  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0474  cytochrome-c oxidase  30.57 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1826  cytochrome c oxidase polypeptide II precursor (cytochrome AA3 subunit 2)  30.74 
 
 		 303 aa  103  3e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.308898  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 		 388 aa  104  3e-21  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  29.48 
 
 		 374 aa  103  5e-21  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  28.99 
 
 		 418 aa  102  7e-21  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0237  cytochrome c oxidase, subunit II  28.99 
 
 		 418 aa  102  8e-21  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0206186 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2349  cytochrome c oxidase, subunit II  29.17 
 
 		 285 aa  102  8e-21  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.159121  normal  0.911923 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  28.85 
 
 		 524 aa  102  8e-21  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0741  cytochrome c oxidase, subunit II  27.92 
 
 		 287 aa  102  8e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0456  cytochrome c oxidase, subunit II  31.12 
 
 		 532 aa  102  1e-20  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2425  cytochrome c oxidase subunit II  31.4 
 
 		 314 aa  102  1e-20  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.408327 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0709  cytochrome c oxidase subunit II  30.96 
 
 		 355 aa  102  1e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.669005  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3155  cytochrome c oxidase, subunit II  30.64 
 
 		 320 aa  101  1e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  28.07 
 
 		 405 aa  101  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  29.32 
 
 		 366 aa  102  1e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 		 422 aa  102  1e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0828  cytochrome c oxidase, subunit II  28.36 
 
 		 279 aa  102  1e-20  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.289421  normal  0.503108 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  29.92 
 
 		 538 aa  101  2e-20  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  30.29 
 
 		 519 aa  100  3e-20  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  28.73 
 
 		 375 aa  100  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A6176  cytochrome c oxidase, subunit II  29.87 
 
 		 531 aa  100  3e-20  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.678657 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  28.36 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0878  cytochrome c oxidase, subunit II  32.24 
 
 		 401 aa  100  4e-20  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0260  cytochrome c oxidase, subunit II  28.11 
 
 		 288 aa  100  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.150091  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  30.08 
 
 		 375 aa  100  4e-20  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  29.74 
 
 		 532 aa  100  4e-20  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>