More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Svir_10630 on replicon NC_013159
Organism: Saccharomonospora viridis DSM 43017



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  100 
 
 		 315 aa  654    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  62.15 
 
 		 311 aa  393  1e-108  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  51.31 
 
 		 316 aa  318  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  43.87 
 
 		 398 aa  290  2e-77  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  43.25 
 
 		 344 aa  269  4e-71  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  43.77 
 
 		 363 aa  268  5.9999999999999995e-71  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  40.75 
 
 		 366 aa  268  1e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  42.41 
 
 		 352 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  42.41 
 
 		 352 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  42.41 
 
 		 352 aa  265  7e-70  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  42.64 
 
 		 344 aa  263  2e-69  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  52.63 
 
 		 289 aa  258  1e-67  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  45.61 
 
 		 269 aa  251  8.000000000000001e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  44.17 
 
 		 323 aa  238  1e-61  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  43.46 
 
 		 323 aa  232  5e-60  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  43.73 
 
 		 287 aa  221  9.999999999999999e-57  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  43.12 
 
 		 314 aa  213  2.9999999999999995e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  43.95 
 
 		 288 aa  207  1e-52  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  44.58 
 
 		 265 aa  206  3e-52  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  41.98 
 
 		 316 aa  206  6e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  42.98 
 
 		 340 aa  201  9.999999999999999e-51  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  44.63 
 
 		 275 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  39 
 
 		 260 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  39.86 
 
 		 299 aa  191  2e-47  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  38.43 
 
 		 289 aa  185  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  39.76 
 
 		 280 aa  184  1.0000000000000001e-45  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  36.59 
 
 		 304 aa  180  2e-44  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  36.96 
 
 		 324 aa  179  4e-44  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  38.64 
 
 		 304 aa  179  4.999999999999999e-44  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  35.62 
 
 		 324 aa  179  4.999999999999999e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  37.59 
 
 		 290 aa  174  2.9999999999999996e-42  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  34.78 
 
 		 312 aa  169  4e-41  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  36.79 
 
 		 290 aa  164  1.0000000000000001e-39  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  32.76 
 
 		 299 aa  162  5.0000000000000005e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  36.51 
 
 		 288 aa  161  1e-38  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  34.04 
 
 		 257 aa  144  2e-33  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  30.74 
 
 		 286 aa  135  7.000000000000001e-31  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  30.15 
 
 		 377 aa  120  3.9999999999999996e-26  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  29.59 
 
 		 281 aa  116  3.9999999999999997e-25  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  33.17 
 
 		 511 aa  113  4.0000000000000004e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  31.36 
 
 		 519 aa  112  8.000000000000001e-24  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 		 401 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  29.67 
 
 		 401 aa  111  1.0000000000000001e-23  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  29.37 
 
 		 388 aa  110  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  32.87 
 
 		 528 aa  109  7.000000000000001e-23  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  32.74 
 
 		 524 aa  108  8.000000000000001e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  28.06 
 
 		 405 aa  107  3e-22  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  32.69 
 
 		 513 aa  106  4e-22  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  31.12 
 
 		 513 aa  106  5e-22  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 		 518 aa  106  6e-22  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  31.12 
 
 		 513 aa  106  6e-22  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 		 518 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  30.34 
 
 		 366 aa  105  8e-22  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  31.92 
 
 		 524 aa  105  8e-22  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  30.38 
 
 		 518 aa  105  8e-22  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0407  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 435 aa  105  9e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  30.34 
 
 		 374 aa  105  9e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  30.08 
 
 		 512 aa  105  1e-21  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0096  cytochrome c oxidase, subunit II  27.95 
 
 		 334 aa  105  1e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.296292  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  28.92 
 
 		 375 aa  105  1e-21  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  30.71 
 
 		 513 aa  105  1e-21  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 		 518 aa  105  1e-21  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  29.41 
 
 		 523 aa  104  2e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  29.92 
 
 		 387 aa  104  2e-21  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3558  cytochrome c oxidase subunit II  31.84 
 
 		 370 aa  103  3e-21  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.22857 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  33.49 
 
 		 513 aa  103  3e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  31.48 
 
 		 520 aa  103  3e-21  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  28.96 
 
 		 378 aa  103  3e-21  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2263  cytochrome c oxidase, subunit II  32.16 
 
 		 367 aa  102  1e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0175262  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  27.84 
 
 		 373 aa  101  2e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  31.75 
 
 		 521 aa  100  3e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2072  cytochrome c oxidase, subunit II  33.18 
 
 		 425 aa  100  4e-20  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.54281 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  28.29 
 
 		 544 aa  99.8  5e-20  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4506  cytochrome c oxidase, subunit II  29.72 
 
 		 304 aa  99.8  6e-20  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.578189 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  28.37 
 
 		 311 aa  99  8e-20  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  31.49 
 
 		 384 aa  97.8  2e-19  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  30.96 
 
 		 374 aa  97.4  3e-19  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0621  cytochrome c oxidase, subunit II  28.69 
 
 		 255 aa  97.1  3e-19  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  decreased coverage  0.0000000345466  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1855  cytochrome c oxidase, subunit II  31.28 
 
 		 356 aa  97.1  3e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001445  cytochrome c oxidase polypeptide II  31.25 
 
 		 356 aa  97.1  4e-19  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.633895  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5244  cytochrome c oxidase, subunit II  26.17 
 
 		 326 aa  96.3  7e-19  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0788277  normal  0.868201 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0142  cytochrome c oxidase, subunit II  30.18 
 
 		 374 aa  95.9  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  28.11 
 
 		 375 aa  95.5  1e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2602  cytochrome c oxidase subunit II  28.04 
 
 		 315 aa  95.5  1e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.405519 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  27.66 
 
 		 377 aa  95.1  1e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  28.63 
 
 		 375 aa  95.1  1e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0300  cytochrome c oxidase, subunit II  28.19 
 
 		 254 aa  94.4  2e-18  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01475  chain II protein of putative cytochrome c oxidase  29.95 
 
 		 234 aa  94.4  2e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  27.71 
 
 		 375 aa  94.7  2e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2792  cytochrome c oxidase, subunit II  32.66 
 
 		 330 aa  94.7  2e-18  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.625738  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 375 aa  94  3e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0584  cytochrome c oxidase, subunit II  25.52 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0567  cytochrome c oxidase, subunit II  25.52 
 
 		 320 aa  94  3e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  27.76 
 
 		 525 aa  93.6  4e-18  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1449  cytochrome c oxidase, subunit II  27.62 
 
 		 346 aa  93.6  4e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.015711 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4171  putative cytochrome c oxidase  27.13 
 
 		 538 aa  93.6  4e-18  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.82291  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3892  cytochrome c oxidase subunit II  33.97 
 
 		 345 aa  92.8  7e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.740774  normal  0.178097 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4071  cytochrome c oxidase, subunit II  24.75 
 
 		 328 aa  92.8  7e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  27.45 
 
 		 380 aa  92.4  8e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  27.35 
 
 		 320 aa  92.4  8e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>