More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_3309 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008705  Mkms_3360  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 352 aa  726    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.773952  normal  0.0585586 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3309  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 352 aa  726    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.49691  normal  0.220958 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3298  cytochrome c oxidase, subunit II  100 
 
 		 352 aa  726    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3564  cytochrome c oxidase, subunit II  77.71 
 
 		 344 aa  532  1e-150  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.205108  normal  0.039922 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2949  cytochrome c oxidase, subunit II  76.06 
 
 		 344 aa  530  1e-149  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_12228  transmembrane cytochrome C oxidase subunit II ctaC  73.01 
 
 		 363 aa  500  1e-140  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.272758  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3061  cytochrome c oxidase subunit II  53.35 
 
 		 398 aa  361  1e-98  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.708633  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1537  cytochrome c oxidase subunit II  49.56 
 
 		 366 aa  331  1e-89  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.162083  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1367  cytochrome c oxidase, subunit II  47.03 
 
 		 311 aa  297  2e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4128  cytochrome c oxidase subunit II  45.14 
 
 		 269 aa  259  6e-68  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3255  cytochrome c oxidase subunit II  41.55 
 
 		 316 aa  258  1e-67  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000163024  hitchhiker  0.0000318285 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3532  cytochrome c oxidase subunit II  43.93 
 
 		 323 aa  251  1e-65  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.636307  decreased coverage  0.000170854 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3300  cytochrome c oxidase, subunit II  42.68 
 
 		 323 aa  249  7e-65  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.86185  normal  0.446784 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3345  cytochrome c oxidase, subunit II  46.67 
 
 		 289 aa  247  2e-64  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_10630  heme/copper-type cytochrome/quinol oxidases, subunit 2  42.47 
 
 		 315 aa  238  1e-61  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.315267 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1667  cytochrome c oxidase, subunit II  35.84 
 
 		 287 aa  181  1e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.23675 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1289  cytochrome c oxidase, subunit II  36 
 
 		 275 aa  179  7e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.353123  normal  0.740937 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3117  cytochrome c oxidase, subunit II  36.33 
 
 		 316 aa  178  1e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.762727  normal  0.80653 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1801  cytochrome c oxidase subunit II  36.15 
 
 		 288 aa  174  1.9999999999999998e-42  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.191358 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2670  cytochrome c oxidase, subunit II  36.71 
 
 		 265 aa  172  9e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0983455  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3078  cytochrome c oxidase, subunit II  35.11 
 
 		 260 aa  171  2e-41  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000302907  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1015  cytochrome c oxidase subunit II  35.1 
 
 		 314 aa  168  1e-40  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0476756  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2082  cytochrome c oxidase, subunit II  34.88 
 
 		 289 aa  167  2.9999999999999998e-40  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3259  Cytochrome c oxidase subunit II  33.23 
 
 		 324 aa  166  4e-40  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0696554 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2016  cytochrome c oxidase, subunit II  32.43 
 
 		 304 aa  163  4.0000000000000004e-39  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3150  cytochrome c oxidase, subunit II  37.41 
 
 		 340 aa  163  5.0000000000000005e-39  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_16250  cytochrome c oxidase, subunit II  32.15 
 
 		 304 aa  157  2e-37  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.178752  normal  0.538576 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1954  cytochrome c oxidase, subunit II  31.23 
 
 		 290 aa  154  2e-36  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000330547 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15630  cytochrome c oxidase, subunit II  32.59 
 
 		 299 aa  153  4e-36  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.806307  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3141  cytochrome c oxidase, subunit II  32.22 
 
 		 324 aa  150  4e-35  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_12220  cytochrome c oxidase, subunit II  31.33 
 
 		 286 aa  147  2.0000000000000003e-34  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.0561533  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0956  cytochrome c oxidase, subunit II  32.08 
 
 		 280 aa  147  3e-34  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.137087 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2217  cytochrome c oxidase, subunit II  31.47 
 
 		 290 aa  146  5e-34  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120292  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1453  cytochrome c oxidase, subunit II  30.63 
 
 		 299 aa  145  9e-34  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0600133  normal  0.252589 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1885  cytochrome c oxidase, subunit II  33.59 
 
 		 288 aa  144  2e-33  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.247552  hitchhiker  0.00527672 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14120  cytochrome c oxidase, subunit II  29.96 
 
 		 312 aa  142  9e-33  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3047  cytochrome c oxidase, subunit II  28.57 
 
 		 281 aa  109  9.000000000000001e-23  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000000013174  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0236  cytochrome c oxidase, subunit II  29.7 
 
 		 519 aa  106  5e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.717105  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0293  cytochrome c oxidase, subunit II  29.63 
 
 		 311 aa  104  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.142345  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0180  cytochrome c oxidase subunit II  29.96 
 
 		 366 aa  100  3e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4246  cytochrome c oxidase, subunit II  28.67 
 
 		 384 aa  99.4  8e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2717  cytochrome c oxidase, subunit II  26.74 
 
 		 523 aa  97.8  3e-19  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.977219  normal  0.293993 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_01290  cytochrome c oxidase, subunit II  29.18 
 
 		 374 aa  97.8  3e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.46157  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04019  cytochrome c oxidase, subunit II  28.11 
 
 		 308 aa  96.3  7e-19  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0310  cytochrome c oxidase, subunit II  28.06 
 
 		 320 aa  95.5  1e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0572725 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0036  cytochrome c oxidase, subunit II  26.4 
 
 		 378 aa  94  4e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4606  cytochrome c oxidase, subunit II  27.39 
 
 		 513 aa  93.6  5e-18  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0079  cytochrome c oxidase, subunit II  26.55 
 
 		 375 aa  92.8  8e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2962  cytochrome c oxidase, subunit II  27.34 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2811  cytochrome c oxidase, subunit II  27.34 
 
 		 401 aa  92.4  1e-17  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3483  cytochrome c oxidase, subunit II  28.3 
 
 		 520 aa  92  1e-17  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.243767 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0103  cytochrome c oxidase, subunit II  27.13 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.193198 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0879  cytochrome c oxidase, subunit II  28 
 
 		 373 aa  91.7  2e-17  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0117  cytochrome c oxidase, subunit II  27.13 
 
 		 375 aa  91.7  2e-17  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0102376 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3991  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 513 aa  91.7  2e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3864  cytochrome c oxidase, subunit II  27.78 
 
 		 513 aa  90.5  3e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3791  cytochrome c oxidase, subunit II  27.41 
 
 		 513 aa  90.5  4e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3999  cytochrome c oxidase subunit II  28.57 
 
 		 524 aa  90.1  5e-17  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0119  cytochrome c oxidase, subunit II  25.97 
 
 		 375 aa  89.7  7e-17  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3818  cytochrome c oxidase, subunit II  27.41 
 
 		 388 aa  89.4  9e-17  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.198752 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01020  cytochrome c oxidase, subunit II  28.68 
 
 		 385 aa  89  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24737  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06272  cytochrome c oxidase, subunit II  25.87 
 
 		 405 aa  89  1e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0178  cytochrome c oxidase, subunit II  28.74 
 
 		 513 aa  89.4  1e-16  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3517  cytochrome c oxidase, subunit II  26.4 
 
 		 511 aa  88.6  1e-16  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1038  cytochrome c oxidase, subunit II  29.51 
 
 		 388 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2406  cytochrome c oxidase, subunit II  24.3 
 
 		 377 aa  88.2  2e-16  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0122  cytochrome c oxidase, subunit II  26.36 
 
 		 375 aa  87.4  3e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.946881 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1824  cytochrome c oxidase subunit II  37.88 
 
 		 257 aa  87.4  3e-16  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1245  cytochrome c oxidase, subunit II  28.19 
 
 		 400 aa  87  5e-16  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.731852  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04013  Cytochrome c oxidase, subunit II  25.77 
 
 		 387 aa  87  5e-16  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.94805  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0258  cytochrome c oxidase, subunit II  25 
 
 		 528 aa  86.7  5e-16  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3782  cytochrome c oxidase, subunit II  25.74 
 
 		 512 aa  86.7  6e-16  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0314  cytochrome c oxidase, subunit II:cytochrome c, class I:cytochrome C oxidase subunit II, transmembrane region  26.81 
 
 		 421 aa  86.3  7e-16  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.659537  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4392  cytochrome c oxidase, subunit II  25.72 
 
 		 392 aa  84.7  0.000000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3181  putative cytochrome C oxidase polypeptide II precursor  25.53 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.8149  normal  0.584186 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1940  cytochrome c oxidase, subunit II  25.94 
 
 		 385 aa  84  0.000000000000003  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.0684443  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0154  cytochrome c oxidase, subunit II  26.02 
 
 		 518 aa  84  0.000000000000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0183  cytochrome c oxidase, subunit II  27.48 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  decreased coverage  0.000324421  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1777  cytochrome c oxidase, subunit II  27.1 
 
 		 377 aa  83.6  0.000000000000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.302976  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4112  cytochrome c oxidase, subunit II  26.02 
 
 		 518 aa  83.2  0.000000000000007  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4311  cytochrome c oxidase, subunit II  26.22 
 
 		 518 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.997623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0614  cytochrome-c oxidase  29.08 
 
 		 303 aa  82  0.00000000000001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.840942  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4180  cytochrome c oxidase, subunit II  26.22 
 
 		 518 aa  82.4  0.00000000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1674  cytochrome c oxidase, subunit II  25.16 
 
 		 380 aa  82.4  0.00000000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1405  cytochrome-c oxidase  24.61 
 
 		 343 aa  82.4  0.00000000000001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.0686645  normal  0.926821 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0325  cytochrome c oxidase subunit II  26.79 
 
 		 382 aa  81.3  0.00000000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.0125401 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1680  cytochrome c oxidase, subunit II  26.06 
 
 		 402 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.450721  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3907  cytochrome c oxidase, subunit II  26.15 
 
 		 390 aa  81.3  0.00000000000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0261  cytochrome c oxidase subunit II  26.32 
 
 		 422 aa  80.9  0.00000000000003  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.814908 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0125  cytochrome c oxidase, subunit II  25.67 
 
 		 521 aa  80.5  0.00000000000004  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0062  cytochrome c oxidase, subunit II  24.91 
 
 		 374 aa  80.5  0.00000000000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.0885746  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0426  cytochrome c oxidase, subunit II  25.32 
 
 		 525 aa  80.5  0.00000000000005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2336  cytochrome c oxidase, subunit II  26.64 
 
 		 304 aa  80.1  0.00000000000005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.273176  normal  0.955931 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0474  cytochrome-c oxidase  27.94 
 
 		 303 aa  79.7  0.00000000000007  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1645  cytochrome c oxidase, subunit II  26.34 
 
 		 385 aa  79  0.0000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.856042  normal  0.904416 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0218  cytochrome c oxidase, subunit II  25 
 
 		 418 aa  79  0.0000000000001  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.468069  normal  0.633646 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1380  cytochrome c oxidase, subunit II  24.6 
 
 		 389 aa  79  0.0000000000001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.459391  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0544  cytochrome c oxidase, subunit II  25.24 
 
 		 544 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.214831  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0198  cytochrome-c oxidase  27.2 
 
 		 524 aa  79  0.0000000000001  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2847  cytochrome c oxidase, subunit II  23.81 
 
 		 532 aa  79  0.0000000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>